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齐齐哈尔医学院学报2025年第46卷第6期JournalofQiqiharMedicalUniversityꎬ2025ꎬVol.46ꎬNo.6501
论著
基于生物信息学分析氧化石墨烯量子点刺激的小鼠骨髓
间充质干细胞对多发性骨髓瘤的影响及潜在分子机制
魏子媛刘丹阳张晓东王璐璐李永涛沈雷
161006黑龙江齐齐哈尔ꎬ齐齐哈尔医学院2022级研究生医学技术1班(魏子媛)ꎻ齐齐哈尔医
学院解剖学教研室(张晓东、李永涛)ꎻ黑龙江省药食同源资源与代谢性疾病防治重点实验
室(刘丹阳、王璐璐、沈雷)
通信作者:沈雷ꎬEmail:278379177@qq.com
基金项目:黑龙江省自然科学基金联合引导项目(LH2021H121)
-
DOI:10.3969/j.issn.10021256.2025.6.001
【摘要】目的探讨氧化石墨烯量子点(GOQD)刺激的小鼠骨髓间充质干细胞(mBMSC)对小鼠多
发性骨髓瘤发生过程的影响及其潜在分子机制ꎮ方法正常培养的mBMSC为对照组ꎬ含100μg/ml
GOQD培养的mBMSC为实验组ꎮ两组均在37℃、5%CO条件下培养24h后ꎬ转录组测序技术检测两组
2
-
基因ꎮR4.2.1的EdgeR包筛选实验组的差异表达基因(GOQDDEG)ꎻGEO数据库的GSE6980数据集获
---
得小鼠多发性骨髓瘤差异表达基因(MMDEG)ꎬ对GOQDDEG和MMDEG的交集基因进行后续分析ꎮ
FgseaR包和GO.dbR包对交集基因的生物过程、分子功能、KEGG信号通路进行分析ꎻClusterProfilerR包
进行基因集富集分析(GSEA)ꎻString构建交集基因编码的蛋白质与蛋白质相互作用网络(PPI)ꎬCytohubba
-
v0.1App筛选排名前10的核心蛋白ꎬstats4.2.1R包和car3.10R包分析核心蛋白在多发性骨髓瘤的表
达ꎬpROC1.18.0R包绘制核心蛋白在小鼠多发性骨髓瘤数据集的ROC曲线ꎮ结果实验组有2025个
-
GOQDDEGꎬ小鼠多发性骨髓瘤包括594个差异表达基因ꎬ两种差异表达基因交集含51个基因ꎮGSEA
表明这些交集基因抑制补体和凝血级联通路ꎬ下调体液免疫调节或创伤反应过程ꎮAce、Tcf7l2、Hdc、Lrg1、
Cfh、Clu、C3、Serpinb6b、Acss2核心蛋白在小鼠多发性骨髓瘤中高表达ꎬ所有核心蛋白的AUC0.92ꎮ结论
GOQD刺激的mBMSC与小鼠多发性骨髓瘤包括51个交集基因ꎬ这些基因在多发性骨髓瘤中下调补体
和凝血级联通路ꎬ抑制体液免疫ꎻ编码的核心蛋白在多发性骨髓瘤高表达ꎬ对多发性骨髓瘤诊断具有重要
意义ꎬGOQD刺激的mBMSC可能具有潜在的促进小鼠多发性骨髓瘤发生作用ꎮ
【关键词】多发性骨髓瘤ꎻ转录组测序技术ꎻ氧化石墨烯量子点ꎻ小鼠骨髓间充质干细胞ꎻ
生物信息学
Impactandpotentialmolecularmechanismsanalysisofgrapheneoxidequantumdotsstimulatedmouse
originbonemarrowmesenchymalstemcellsonmultiplemyelomabasedonbioinformaticsanalysisWei
ZiyuanꎬLiuDanyangꎬZhangXiaodongꎬWangLuluꎬLiYongtaoꎬShenLei.GraduateClass1ofGrade2022ꎬ
MajorofMe
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