三穗鸭体尺与屠宰性状的全基因组关联分析.pdfVIP

河南农业科学，2025，54（6）：135‐143

JournalofHenanAgriculturalSciencesdoi:10.15933/ki.1004-3268.2025.06.015

三穗鸭体尺与屠宰性状的全基因组关联分析

伍革民，韩雪，吴松成，冯宇隆

（贵州省农业科学院畜牧兽医研究所，贵州贵阳550005）

摘要：为了筛选出影响三穗鸭体尺和屠宰性状的遗传位点和功能基因，以655只160日龄三穗鸭为研究

对象，测定体尺（体斜长、颈长）和屠宰性状（宰前活质量、屠体质量、全净膛质量和胸腿肌率）等表型数

据，通过全基因组关联分析（10×深度）获取个体单核苷酸多态性（SNP）基因型，基于PLINK1.9进行质控

分析，利用GEMMA执行混合线性模型关联分析，并通过clusterProfiler对显著关联位点进行KEGG候选

基因功能富集分析。结果表明，分别筛选到与体斜长、颈长、宰前活质量、屠体质量、全净膛质量、胸腿

肌率显著关联的SNP位点207、78、64、66、68、96个，分别注释到50、31、32、40、27、37个候选基因。

KEGG富集分析结果表明，与体斜长、颈长、宰前活质量、屠体质量、全净膛质量和胸腿肌率关联的候选

基因分别富集到16、10、12、11、13、22条KEGG通路。其中，神经活性配体-受体相互作用与6个性状均

有关，钙信号通路与体斜长、屠体质量、全净膛质量和胸腿肌率有关，MAPK信号通路与宰前活质量、屠

体质量和全净膛质量有关。LOC119717855、GPR50、GRM7、GABRB2、GABRG2、LOC101800857等基因是

体斜长的关键候选基因，GRIK2、BNIP1等基因是颈长的关键候选基因，TAF2和NRK基因是宰前活质

量、屠体质量和全净膛质量的关键候选基因，SLC8A1基因是屠体质量和全净膛质量的关键候选基因，

HTR2A、QRFPR、NPVF和UTS2R等基因是胸腿肌率的关键候选基因。综上，影响三穗鸭体尺与屠宰性

状的主要KEGG通路为神经活性配体-受体相互作用、钙信号等信号通路，关键候选基因为

LOC119717855、GPR50、GRIK2、TAF2等。

关键词：三穗鸭；全基因组关联分析；体尺性状；屠宰性状；候选基因

中图分类号：S831.2文献标志码：A文章编号：1004-3268（2025）06-0135-09

Genome‐wideAssociationStudyofBodySizeandSlaughter

TraitsinSansuiDuck

WUGemin，HANXue，WUSongcheng，FENGYulong

（InstituteofAnimalHusbandryandVeterinaryScience，GuizhouAcademyofAgriculturalSciences，Guiyang550005，

China）

Abstract：：Toscreenoutthegeneticlociandfunctionalgenesaffectingthebodysizeandslaughtertraits

ofSansuiducks，655160‐day‐oldSansuiducksweretakenastheresearchsubjects，andthephenotypic

datasuchasbodysize（bodyskewlength，necklength）andslaughtertraits（pre‐slaughterliveweight，

carcassweight，eviscerationweightandchestandlegmusclerate）weremeasured.Theindividualsingle

nucleotidepolymorphism（SNP）genotypeswereobtainedbygenome‐wideassociationstudy