猪背膘厚和100 kg日龄全基因组关联分析和基因组选择分析.pdfVIP

安徽农业大学学报,2025,52(4):655-663

JournalofAnhuiAgriculturalUniversity

[DOI]10.13610/ki.1672-352x018网络出版时间：2025-09-1614:42:03

[URL]/urlid/34.1162.s1436.036

猪背骠厚和100kg日龄全基因组关联分析和基因组选择分析

郁辰龙，史丽莎，张冰，荣耀，布宇，丁月云，张晓东，郑先瑞，殷宗俊*

(安徽农业大学动物科技学院，安徽合肥230036)

摘要：【目的】利用全基因组关联分析（genome-wideassociationstudies，GWAS）探究美系猪校正背骠厚及100

千克体质量日龄2个性状的分子遗传机制，挖掘候选基因，同时研究两者的遗传力和相关性，为种猪的遗传改良提供

科学依据。【方法】试验使用“中芯一号”芯片对545头健康成年美系猪（包括73头杜洛克、189头长白猪和283头大

白猪）进行了SNP分型。通过Plink（V1.90）软件对基因型数据进行质控和主成分分析，剔除离群较为严重个体数

据，以确保数据质量的可靠性。分别对3个群体进行背厚和100kg体质量日龄性状的GWAS和基因组选择(genomic

selection，GS）分析。【结果】GWAS结果注释后发现，共有11个基因处于背骠厚显著位点范围内；13个基因处于

100kg体质量日龄性状显著位点范围内。GO富集分析结果显示，背骠厚与胆固醇结合和蛋白质结合等功能富集相关；

100kg体质量日龄性状与外周神经系统髓鞘形成、蛋白质磷酸化等功能相关。遗传力估计结果显示，基于GBLUP的

遗传力分别为：大白猪、长白猪和杜洛克猪的背厚遗传力分别为0.31、0.2和0.6，100kg体质量日龄遗传力分别为

0.27、0.28和0.2；基于BayesCpi模型的遗传力估计结果为：背厚遗传力分别为0.43、0.42和0.52，100kg体质量

日龄遗传力分别为0.12、0.17和0.16。两种模型结果显示出较弱的相关性。【结论】总体而言，100kg体质量日龄被

认为是具有中等遗传力的性状，而校正背厚则是一个高遗传力性状。研究结果为美系猪的本土化饲养和遗传改良提

供了科学依据，并为深入理解畜牧动物肉质性状的遗传调控机制提供了有价值的参考。

关键词：全基因组关联分析；基因组选择；背骠厚；100kg体质量日龄；美系猪；遗传力；功能富集

中图分类号：S828文献标识码：A文章编号：1672-352X(2025)04-0655-09

Genome-wideassociationanalysisandgenomicselectionstudy

ofbackfatthicknessandageat100kgbodyweightinpigs

YUChenlong,SHILisha,ZHANGBing,RONGYao,BUYu,DINGYueyun,

ZHANGXiaodong,ZHENGXianrui,YINZongjun

(SchoolofAnimalScienceandTechnology,AnhuiAgriculturalUniversity,Hefei230036,China)

Abstract:[Objective]Thisstudyaimstoinvestigatethemoleculargeneticmechanismsunderlyingtwo

traits-backfatthicknessadjustedforageat100kgbodyweight-inUSbreedsswinethroughgenome-wideassociation

studies(GWAS).Theobjectivesweretoidentifycandidategenes,estimatethehe