HIV患者转录组及代谢组学研究.pdfVIP

浙江大学硕士学位论文中文摘要

0.05

＜），并通过软件预测各差异基因之间存在复杂的相互作用关系。相较于感染

HDAC6MAPK8mRNATMEM254-AS1LINC00202-1

者，精英控制者中的、等和、

lncRNAIRF3RPS2mRNARN7SL15PTRAF3IP2-AS1

等表达下降；、等和、等

lncRNAmRNAlncRNAmRNA

表达升高。并且差异表达的之间以及差异表达的和

mRNAlncRNA

之间可能存在丰富的靶向调节关系。总体而言，和在精英控制者

中表现出复杂的表达模式，且精英控制者的基因表达情况更接近健康对照。随后，

我们通过Cytoscape软件内的cytoHubba插件构建差异mRNA的蛋白质蛋白质互-

protein-proteininteraction,PPI

相作用网络（），通过皮尔森相关性检验计算差异

lncRNA与差异mRNA之间表达丰度的相关性系数并根据相关性系数绘制

lncRNA-mRNA共表达网络。其中，共计1109对线性关系具有统计学差异（校正

P0.05MAPK8IRF3PPI

＜），、等基因在图中处于中心位置，提示这些基因在抗

MAPK-NF-B

病毒机制中发挥了中心作用，并且多个基因与κ通路密切相关。已

有研究证明lncRNA的基本功能之一是调控mRNA表达，与差异mRNA共表达的

lncRNAmRNAGOGeneOntology

可能通过调控这些差异发挥作用。我们通过（）

KEGGKyotoEncyclopediaofGenesandGenomesmRNA

分析和（）分析来表征差异

的功能，结果显示大部分差异基因的功能都集中在病毒复制和免疫应答等方面，

这表明精英控制者不同于感染者的大部分基因主要在这些方面发挥了重要的作

用。针对这些基因进一步研究精英控制者的病毒控制机制或者设计治疗靶点具有

明显的意义。最后，由于测序样本量较小，我们通过定量PCR的方法在更大的样

本量中随机挑选了几个差异基因进行验证，结果显示大部分基因的表达趋势与测

序结果一致。

在研究的第二部分中，我们为了了解经过长期HAART治疗的患者的预后情况

和生存质量，招募并评估了队列中长期治疗患者的临床基本信息和代谢指标。其

中，脂质代谢紊乱和骨密度降低是普遍存在的两大问题。由于脂质代谢的指标过

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于繁多，为了缩小研究范围，我们挑选出例治疗后表现为低骨量的患者和

例治疗后骨量正常的患者，针对治疗后骨代谢异常进行下一步研究。患者的平均

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