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齐齐哈尔医学院学报２０２５年第４６卷第７期ＪｏｕｒｎａｌｏｆＱｉｑｉｈａｒＭｅｄｉｃａｌＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ２０２５ꎬＶｏｌ.４６ꎬＮｏ.７６０７

论著

基于ＷＧＣＮＡ分析系统性红斑狼疮的关键基因

张琳萄陈春丽崔道林

６５５０００云南曲靖ꎬ曲靖医学高等专科学校机能与形态研究所

通信作者:崔道林ꎬＥｍａｉｌ:ｃｄｌｙｎｕ２００７＠１２６.ｃｏｍ

基金项目:云南省教育厅科学研究基金项目(２０２３Ｊ１７６０)

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ＤＯＩ:１０.３９６９/ｊ.ｉｓｓｎ.１００２１２５６.２０２５.０７.００２

【摘要】目的基于加权基因共表达网络分析(ＷＧＣＮＡ)方法ꎬ筛选与系统性红斑狼疮(ＳＬＥ)相关

的高风险致病基因及其潜在的生物学过程和信号通路ꎬ以为ＳＬＥ的发生、发展及其发病机制提供理论依

据ꎮ方法从ＧＥＯ数据库中下载ＧＳＥ７２３２６基因表达数据集ꎬ利用Ｒ语言的“ＷＧＣＮＡ”包分析ＳＬＥ患者

和正常人血液中的基因共表达变化ꎬ并通过“ＣｌｕｓｔｅｒＰｒｏｆｉｌｅｒ”包对与ＳＬＥ密切相关的基因模块进行功能富

集分析ꎮ使用“ＬＩＭＭＡ”包筛选差异表达基因(ＤＥＧｓ)ꎬ将ＤＥＧｓ与ＷＧＣＮＡ筛选出的共同致病基因进行结

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合分析ꎬ并导入ＳＴＲＩＮＧ数据库进行蛋白蛋白相互作用(ＰＰＩ)网络分析ꎮ最终ꎬ通过Ｃｙｔｏｓｃａｐｅ软件筛选

出关键基因(Ｈｕｂ基因)ꎮ结果共筛选出９１个差异表达基因ꎬ鉴定出１个与ＳＬＥ密切相关的基因模块

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(黄色模块ꎬＣｏｒ０.６７ꎬＰ８.３ｅ１４)ꎬ该模块主要涉及病毒防御、Ｉ型干扰素信号通路、细胞因子介导的信号

通路等生物学过程ꎮ进一步筛选出１５个Ｈｕｂ基因ꎬ包括:ＩＦＩ４４、ＩＦＩ４４Ｌ、ＩＦＩＴ１、ＩＦＩＴ２、ＩＦＩＴ３、ＲＳＡＤ２、ＩＦＩＨ１、

ＩＳＧ１５、ＭＸ１、ＯＡＳ１、ＯＡＳ２、ＯＡＳ３、ＩＦＩ３５、ＥＩＦ２ＡＫ２、ＤＤＸ５８ꎮ结论通过ＷＧＣＮＡ生物信息学方法ꎬ筛选出了

与ＳＬＥ密切相关的１５个关键基因ꎬ这为深入探索ＳＬＥ的发病机制提供了理论支持ꎬ且这些基因可能成为

未来ＳＬＥ治疗的潜在靶点ꎮ

【关键词】系统性红斑狼疮ꎻ生物信息学ꎻ关键基因

ＡｎａｌｙｓｉｓｏｆｋｅｙｇｅｎｅｓｉｎｓｙｓｔｅｍｉｃｌｕｐｕｓｅｒｙｔｈｅｍａｔｏｓｕｓｂａｓｅｄｏｎＷＧＣＮＡＺｈａｎｇＬｉｎｔａｏꎬＣｈｅｎＣｈｕｎｌｉꎬ

ＣｕｉＤａｏｌｉｎ

ＩｎｓｔｉｔｕｔｅｏｆＦｕｎｃｔｉｏｎａｎｄＭｏｒｐｈｏｌｏｇｙꎬＱｕｊｉｎｇＭｅｄｉｃａｌＣｏｌｌｅｇｅꎬＱｕｊｉｎｇꎬＹｕｎｎａｎ６５５０００ꎬＣｈｉｎａ

Ｃｏｒｒｅｓｐｏｎｄｉｎｇａｕｔｈｏｒ:ＣｕｉＤａｏｌｉｎꎬＥｍａｉｌ:ｃｄｌｙｎｕ２００７＠１２６.ｃｏｍ

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【Ａｂｓｔｒａｃｔ】ＯｂｊｅｃｔｉｖｅＴｏｉｄｅｎｔｉｆｙｈｉｇｈｒｉｓｋｐａｔｈｏｇｅｎｉｃｇｅｎｅｓｒｅｌａｔｅｄｔｏｓｙｓｔｅｍｉｃｌｕｐｕｓｅｒｙｔｈｅｍａｔｏｓｕｓ

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(ＳＬＥ)ꎬａｎｄｉｔｓｐｏｔｅｎｔｉａｌｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｐｒｏｃｅｓｓｅｓａｎｄｓｉｇｎａｌｉｎｇｐａｔｈｗａｙｓｕｓｉｎｇｗｅｉｇｈｔｅｄｇｅｎｅｃｏｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｎｅｔｗｏｒｋ

ａｎａｌｙｓｉｓ(ＷＧＣＮＡ)ꎬｐｒｏｖｉｄｉｎｇａｔｈｅｏｒｅｔｉｃａｌｂａｓｉｓｆｏｒｕｎｄｅｒｓｔａｎｄｉｎｇｔｈｅｐａｔｈｏｇｅｎｅｓｉｓａｎｄｐｒｏｇｒｅｓｓｉｏｎｏｆＳＬＥ.

ＭｅｔｈｏｄｓＴｈｅＧＳＥ７２３２６ｄａｔａｓｅｔｗａｓｄｏｗｎｌｏａｄｅｄｆｒｏｍｔｈｅＧＥＯｄａｔａｂａｓｅꎬａｎｄｔｈｅ“ＷＧＣＮＡ”ｐａｃｋａｇｅｉｎＲ