03蛋白质结构 名校精品课件.pptVIP

氨基酸脱水缩合成肽一级结构二级结构通论三级结构四级结构小结脱水缩合加水分解肽键(酰胺键)一级结构二级结构三级结构四级结构氨基酸顺序α-螺旋多肽链（单体蛋白或亚基）寡聚蛋白基本结构(一级结构)多肽链中氨基酸的排列顺序由肽键连接而成的结构三维结构（高级结构）二级结构三级结构四级结构一级结构决定高级结构,高级结构决定蛋白质功能二级结构多肽链主链构象,主要动力：氢键,主要形式：α-螺旋，β-折叠片层三级结构多肽链主链构象加侧链构象主要动力：疏水作用四级结构由至少两个亚基（多肽链）聚合而成的蛋白质,动力：氢键、离子键、疏水作用等蛋白质的结构层次一级结构二级结构通论三级结构四级结构小结维持基本机构的肽键一级结构二级结构通论三级结构四级结构小结丝氨酰-甘氨酰-酪氨酰-甘氨酰-亮氨酸(五肽)氨基端(N端)羧基端(C端)主干链:N-C-C-N-C-C-N-C-C-N-C-C-N-C-C维持高级结构的副键一级结构二级结构通论三级结构四级结构小结一级结构二级结构通论三级结构四级结构小结牛胰岛素序列A链B链链内二硫键链间二硫键核糖核酸酶序列二硫键是主键还是副键?肽键平面一级结构二级结构通论三级结构四级结构小结α=180°,β=180°的构象氨基端羧基端N-Cα旋转角φCα-C旋转角ψ肽键C-N的部分双键性质,其键长小于胺中的C-Nα-螺旋(规则二级结构)一级结构二级结构通论三级结构四级结构小结氨基端羧基端碳氢氧氮R基团3.6个氨基酸残基重复单位N-Ca键角f~-60°--55°Ca-C键角y~-45°--50°O-------------------H|||-C--NH-CαH-CO--N-|R315第1个残基C=O与第5残基NH间形成氢键侧链对α-螺旋的影响一级结构二级结构通论三级结构四级结构小结使α-螺旋不稳定的因素……临近侧链同为正电荷或负电荷的排斥作用如果重复出现Asn,Ser,Thr,Leu，它们的形状和大小对螺旋的阻碍作用脯氨酸……-N-Ca键是无法旋转的，因此螺旋在此将中断而形成扭结，另一方面，脯氨酸的N上无H，一致于无法形成氢键甘氨酸……-因为侧链过于简单而导致构象太“柔顺”使α-螺旋更加稳定的因素……相隔3个残基的2个侧链（n，n+5侧链）上有正电荷和负电荷将形成离子键结合相隔3个残基的2个侧链（n，n+5侧链）都是疏水侧链将疏水连接（疏水作用）β-折叠片(规则二级结构)一级结构二级结构通论三级结构四级结构小结β-折叠片层的两种形式1.同向平行2.反向平行β-转角(不规则二级结构)一级结构二级结构通论三级结构四级结构小结Gly侧链H氨基酸2和3之肽键可自由的与水形成氢键甘氨酸和脯氨酸最易引起180°转角β-凸起(不规则二级结构)一级结构二级结构通论三级结构四级结构小结三级结构的组建模块一级结构二级结构通论三级结构四级结构小结超二级结构由二级结构组合成的三级结构组件主要存在于球状蛋白β-α-β花式α-环-α花式如Ca2+结合蛋白如DNA结合蛋白β-发夹(ββ花式)2发夹花式αα花式三级结构的组建模块一级结构二级结构通论三级结构四级结构小结结构域由超二级结构（花式）组成结构域结构域是指由花式或二级结构组合形成的局部折叠区域球状蛋白质的独立折叠单位，通常也是蛋白质的功能单位（功能域）小的单体蛋白只有一个结构域结构域=三级结构大的单体蛋白有数个结构域由4个β-α-β花式组成的α/β桶结构域β-α-β花式α/β桶结构域：丙酮酸激酶纤维状蛋白质通常只含一种二级结构，而球蛋白通常含有多种二级结构球状蛋白质具有明显的折叠层次一级结构→二级结构→超二级结构→结构域、三级结构或亚基