第十三章计算机辅助药物设计.pptVIP

计算机辅助药物设计

Computer-AidedDrugDesign

CADD;;参考教材;;;网址及学术论坛;计算机辅助药物设计;先导化合物及其优化;CADD药物上市成功的例子;计算机硬件;计算机硬件;重要软件;分子结构的实体模型;计算机辅助分子造型术的优越性;计算分子的性质;ChemDraw起始界面;;18;套索

实键

双键

虚键

切割键

切割楔键

黑体键

黑体楔键

空心楔键

波浪键

表格

长链

环丙烷环

环戊烷环

环庚烷环

环己烷椅式

环戊二烯环;键工具;模板工具;模板工具;模板工具;模板工具;模板工具;模板工具;模板工具;模板工具;模板工具;模板工具;模板工具;模板工具;模板工具;模板工具;模板工具;36;Chem3D软件;工具栏;主要功能;主要功能;显示设置;显示设置属性;Wireframe;;计算菜单：对所绘制构型进行分子动力学、构型优化以及性质计算等;MM2分子力学功能：;Gamess计算功能：;SYBYL;例：TRIPOS分子设计系列软件;MOLCAD;QSAR;CoMFA-Interpretation;Pharmacophore药效团分析;Biopolymer（生物大分子）;蛋白质飘带图;蛋白质绳图;受体-配体结合模型;受体-配体结合模型;受体-配体结合模型;分子对接;ChemicalInformatics

化学信息学

;计算机辅助药物设计分类;1、基于受体的药物设计;分子对接;分子对接;分子对接;代表性对接软件;（2）从头设计;从头设计的基本流程;从头设计;2、间接药物设计;（1）定量构效关系QSAR;y：生物活性参数

x：化合物的整体或局部结构参数;化学结构的数值表示;经验参数;理论计算参数;对生物活性数据的要求;常用的生物活性数据;log1/C=-k1π２+k2π+k3σ+k4Es+ks

C：产生指定生物效应的摩尔浓度

π：疏水性参数

σ：电子效应参数

Es：立体参数

k1、k2、k3和k4：权重系数;例;定量方程式;环丙沙星;三维定量构效关系;CoMFA;三维等值图;（2）药效团模型;药效基团;药效团构建的基本步骤;小结;国内药物设计成功的例子;