T7 RNA聚合酶体外转录缓冲液优化及NTP配置.pdfVIP

T7 RNA聚合酶体外转录缓冲液优化及NTP配置.pdf

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T7RNA聚合酶的体外转录:

5XTxnBuffer:

400mMHEPES‑KOH,

pH7.510mM精胺200

mMDTT125mMMgCl2

Th基本的转录缓冲液如上所述。可选成分如下所列w:

在1X浓度下:50mg/mL

PEG‑80002.5U/mL无机焦磷酸酶

在40mM1X浓度下,pH7.9的Tris缓冲液也可以很好地替代HEPES,但

HEPES可能更高的产物产量(S.Li,未的观察结果)。无机焦磷酸酶可

以产生的产物,因为它将可能导致产物抑制的无机磷酸盐转化为磷酸盐。

PEG‑8000也可能增加产量,并会产生的白色沉淀物。

5XNTP缓冲液:

UTP(Sigma,编号U6750,$126)

GTP(Sigma,编号G8877,$348)

CTP(Sigma,编号C1506,$261)

ATP(Calbiochem)

每种NTP20mM,pH8.0

55.4mgUTP

58.7mgGTP

55.1mgATP

52.1mgCTP

至5mL

用约400uL1MNaOH调节pH至~8(使用pH试纸检查)

NTPs从Sigma,并且是钠盐。每种NTP的最终浓度为4mM。使用更高

浓度的NTP可以产生的产物,但钠反离子通常会导致抑制。使用锂或

Tris‑NTP盐可以使NTP浓度增加到20mM(参见Ambion的专利‑

MExn套件中的技术)。NTP在溶于水时需要中和。

RNASecure:

InvitroTranscriptionbyT7RNAPolymerase:

5XTxnBuffer:

400mMHEPES-KOH,pH7.5

10mMspermidine

200mMDTT

125mMMgCl2

Thebasictranscriptionbufferisasabove.Optionalcomponentsarelistedbelow:

At1XConcentration:

50mg/mLPEG-8000

2.5U/mLInorganicPyrophosphatase

ATris-basedbufferat40mM1Xconcentration,pH7.9alsoworkswellinsteadofthe

HEPES,howeverHEPESmaygiveteryieldsofproduct(S.Li,unpublished

observations).InorganicPyrophosphatasemayyieldmoreproductsinceitconverts

inorganicphosphate,whichcanresultinproductinhibition,tophosphate.PEG-8000can

alsoresultinincreasedyieldsandwillyieldmorewhiteprecipitate.

5XNTPBuffer:

UTP(Sigma,Cat#U6750,$126)

GTP(Sigma,Cat#G8877,$348)

CTP(Sigma,Cat#C1506,$261)

ATP(Calbiochem)

20mMeachNTP,pH8.0

55.4mgUTP

58.7mgGTP

55.1mgATP

52.1mgCTP

to5mL

pHw/ca.400uL1MNaOHtopH~8(checkbypHpaper)

NTPsarepurchasedfromSigmaandaresodium

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