基于生物信息学分析的结直肠癌关键基因筛选.pdfVIP

·３９０·湖北医药学院学报（ＪＨＢＵＭ）网址：ｈｔｔｐ：／／ｙｙｙｘ．ｃｂｐｔ．ｃｎｋｉ．ｎｅｔ２０２４年８月，４３（４）

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ｄｏｉ：１０．１３８１９／ｊ．ｉｓｓｎ．２０９６７０８Ｘ．２０２４．０４．０１０

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引用本文格式：李珂云，彭昇，曹镐禄，等．基于生物信息学分析的结直肠癌关键基因筛选［Ｊ］．湖北医药学院学报，２０２４，４３（４）：３９０３９５，

４００．

基于生物信息学分析的结直肠癌关键基因筛选

１，２１１１３

李珂云，彭昇，曹镐禄，曾涵仪，石圣成，

１４３１，２

陈水亲，万绍贵，李珍妮，张文娟

１２

（赣南医科大学基础医学院；心脑血管疾病防治教育部重点实验室；

３４

第一临床医院；基础医学院分子病理学中心，江西赣州３４１０００）

［摘要］目的：筛选结直肠癌发生发展中的关键基因，并分析其与生存预后和肿瘤免疫浸润的关系。方法：从

ＧＥＯ数据库下载结直肠癌基因表达谱ＧＳＥ１７８１４５。用Ｒ软件筛选结直肠癌组织与正常组织样本间的差异表达基

因（ＤＥＧｓ），通过基因本体（ＧＯ）和京都基因与基因组百科全书（ＫＥＧＧ）分析这些基因以确定它们的生物学作用。

构建蛋白相互作用网络（ＰＰＩ）鉴定结直肠癌进展的关键基因，然后通过ＧＥＰＩＡ２数据库验证其表达水平及生存预

后情况。最后利用ＴＩＭＥＲ数据库分析预后相关基因与免疫浸润细胞的相关性。结果：共筛选出８９７个ＤＥＧｓ。ＧＯ

分析表明，ＤＥＧｓ主要集中在调控金属离子输运、离子通道活性、收缩纤维等过程。ＫＥＧＧ通路分析表明ＤＥＧｓ主要

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参与细胞因子受体相互作用、钙信号传导等通路。通过ＰＰＩ分析得到１０个关键基因，使用ＧＥＰＩＡ２数据库验证发