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自然人不同持股方式的纳税差异

原创?LFQ?珺合财税?2026年1月29日?浙江

股权是一个商业社会重要的资产载体，股权无论是何种形式，穿透到最后终是一个个自然人。每个个体基于投资目标以及税负成本等多方面的考虑，选择何种持股方式备受大家关注。

个人投资者持股方式主要包括三种：直接持股、间接持股（包括公司及合伙企业）、直接持股与间接持股相结合。珺合财税本期对不同持股方式所涉及的主要税负税种即所得税的税负成本进行了梳理，以便个人投资者根据自身实际情况，选择更为合理的持股方式。

持有股权的商业目的无非是获取红利或转让溢价退出，针对这两种获利方式涉及的所得税分项分析如下：

一、分红所得

1、自然人直接持股

自然人直接持有普通公司取得的股息红利适用20%个税。

自然人直接持有上市公司、北交所公司或新三板挂牌公司股票，根据下列规定，自然人可以享受股息红利差别化个税政策。

具体为：新三板或北交所公司，持股期限在1个月以内(含1个月)的20%个税，持股期限在1个月以上至1年(含1年)的10%个税；持股期限超过1年的免征个税。

上市公司，限售股解禁前适用10%个税，限售股解禁后或非限售股持股期限在1个月以内(含1个月)的20%个税，持股期限在1个月以上至1年(含1年)的10%个税；持股期限超过1年的免征个税。

具体法规政策列举：

《财政部国家税务总局证监会关于上市公司股息红利差别化个人所得税政策有关问题的通知》（财税〔2015〕101号）规定。

《财政部国家税务总局证监会关于实施上市公司股息红利差别化个人所得税政策有关问题的通知》(财税[2012]85号?)规定。

《关于继续实施全国中小企业股份转让系统挂牌公司股息红利差别化个人所得税政策的公告》（财政部税务总局证监会公告2019年第78号）规定。

2、自然人通过有限合伙企业持股

自然人合伙人通过有限合伙企业持有普通公司取得的股息红利适用20%个税。

自然人合伙人通过有限合伙企业持有上市公司、北交所公司或新三板挂牌公司股票，能否穿透为自然人直接持股享受股息红利差别化个税政策存在很大争议。

一度被网传的税总稽便函〔2018〕88号中规定，不能穿透享受：”财税[2015]101号文件规定，个人从公开发行和转让市场取得上市公司股票，适用上市公司股息红利差别化个人所得税政策。该个人不包括合伙企业的自然人合伙人。”

但是，实务中也有不少公众公司公开披露在挂牌期间，合伙企业取得新三板公司的股息红利时，自然人合伙人也适用了股息红利差别化税收政策。比如，菲鹏生物、联盛化学。

菲鹏生物2017年11月分红时：百奥科技系菲鹏生物合伙企业股东，因合伙企业持有股票而获得的股息红利，不并入合伙企业的收入，而是单独作为自然人的股息红利缴纳个人所得税，故缴纳个人所得税时参照财税[2015]101号的相关规定。考虑到截至该次利润分配股权登记日，百奥科技持有发行人股份期限已超过1年，自然人合伙人免征个人所得税。

台州高投，指台州市高盛投资合伙企业（有限合伙），联盛化学股东：2019年5月分红时经咨询当地税务局，对于合伙企业的自然人合伙人，根据省税务局政策口径，可参照按财税〔2015〕101号规定执行，暂时免征个人所得税，因此未缴纳个人所得税。

有限合伙的组织形式更多的是一个股权控制工具，不是一个税务规划的工具，这在现实中得到了不少的印证。

3、自然人通过有限公司持股

自然人通过有限公司持股时，无论是普通公司还是上市公司或是挂牌公司，适用的税收政策都是一样的。分红至有限公司时：符合条件的居民企业之间的股息红利所得是免税的。有限公司再分红至自然人股东时适用20%个税。

二、转让所得

1、自然人直接持股

自然人直接转让普通公司股权时，转让所得适用财产转让所得20%个税。

自然人直接转让上市公司、北交所公司或新三板挂牌公司股票，根据下列规定，自然人适用不同的个税政策。

具体为：如果是上市公司限售股或新三板公司原始股，转让所得税适用财产转让所得20%个税。如果是上市公司非限售股或新三板公司非原始股，转让所得暂免征收个税。

具体法规政策列举：

《财政部税务总局证监会关于个人转让全国中小企业股份转让系统挂牌公司股票有关个人所得税政策的通知》财税〔2018〕137号。

《财政部国家税务总局证监会关于个人转让上市公司限售股所得征收个人所得税有关问题的通知》财税〔2009〕167号。

2、自然人通过有限合伙企业持股

如果有限合伙企业是普通的持股平台，转让股权所得作为合伙企业的生产经营所得，适用5%~35%的五级超额累进税率计征个人所得税。

如果有限合伙企业是经过备案的创投企业，根据《财政部税务总局发展改革委证监会关于创业投资企业个人合伙人所得税政策问题的通知》（财税〔2019〕8号）的规定：创投企业选择按单一投资基