四翼滨藜叶绿体基因组组装及序列特征分析.pdfVIP

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2024年7月内蒙古大学学报自然科学版Jul.2024

第卷第期()

554JournalofInnerMonoliaUniversitNaturalScienceEditionVol.55No.4

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文章编号:():/

1000-1638202404-0388-09DOI10.13484.nmdxxbzk

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四翼滨藜叶绿体基因组组装及序列特征分析*

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吕昕霏高娜白玉娥

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内蒙古农业大学林学院呼和浩特010019

摘要:,,

本文以库布齐沙漠边缘的四翼滨藜为实验材料采用CTAB法提取其全基因组DNA

,

利用Illumina双端测序技术获得了完整的四翼滨藜叶绿体基因组序列对四翼滨藜叶绿体基

、,。:

因组进行组装注释及序列特征分析并构建系统发育树结果表明四翼滨藜叶绿体基因组

,,,

全长为共注释出个基因含有个编码蛋白基因个基因和个

15064bp132878rRNA37

;,,

基因检测到四翼滨藜有个位点为单核苷酸重复和二核苷酸重复型碱

tRNAMISA49SSR

/;,

基组成以AT碱基类型为主四翼滨藜一共含有20698个密码子其中编码亮氨酸的密码子

,,/;

数量最多存在个偏好密码子有个以碱基结尾系统发育树表明四翼滨藜与中

3029AU

。

亚滨藜有较密切的亲缘关系本文对四翼滨藜叶绿体基因组的研究将为苋科植物的物种鉴

、。

定遗传进化分析和DNA条形码的构建奠定基础

关键词:;;

四翼滨藜叶绿体基因组系统发育分析

中图分类号:;文献标志码:

Q943.2