甘薯抗茎线虫病的QTL定位与分析.pdfVIP

中国农业科学2025,58(17):3389-3399

ScientiaAgriculturaSinicadoi:10.3864/j.issn.0578-1752.2025.17.003

甘薯抗茎线虫病的QTL定位与分析

赵冬兰，马居奎，肖世卓，周志林，赵凌霄，王洁，戴习彬，孙厚俊，曹清河

江苏徐淮地区徐州农业科学研究所，江苏徐州221131

摘要：【目的】分析甘薯（

Ipomoeabatatas(L.)Lam.）抗茎线虫病相关的QTL，为甘薯抗茎线虫病基因的精细定位、克

隆及功能研究奠定基础，同时也为甘薯抗茎线虫病遗传机理研究和培育抗性品种提供支持。【方法】以抗茎线虫病品种豫薯

10号和高感病品系新24为亲本构建包含212个子代的F1群体为试验材料，对其进行田间自然诱发甘薯茎线虫病抗性鉴定，

基于前期构建的遗传图谱，采用复合区间作图法（compositeintervalmapping，CIM）对甘薯抗茎线虫病进行QTL定位与

分析，并对QTL置信区间内的候选基因进行预测。同时，采用rMVP（amemory-efficient、visualization-enhanced、

parallel-acceleratedRpackage）软件对甘薯抗茎线虫病进行全基因组关联分析（genome-wideassociationstudies，

GWAS）。对抗病品种郑红22进行室内接种甘薯茎线虫，在接种线虫后的不同时期进行取样，采用qRT-PCR对筛选的5个候选

基因（itf02g19880、itf02g20080、itf02g20100、itf13g18480和itf13g18550）进行定量表达分析。【结果】共定位到3

个与甘薯抗茎线虫病相关的QTL——qSNR02-1、qSNR02-2和qSNR13-1，分布于第2和第13染色体。单个QTL表型变异解释

率为9.6%—11.7%。经GWAS分析，在第6染色体关联到1个与甘薯抗茎线虫病显著相关的位点。根据基因组注释信息，对

QTL置信区间内的候选基因进行预测，筛选出36个与抗茎线虫病相关的候选基因。候选基因功能注释表明，防御机制相关

的ABC转运蛋白家族、多药及毒性外排转运蛋白（MATE）外排蛋白家族，以及翻译后修饰、蛋白质周转相关的E3泛素连接

酶和谷胱甘肽S转移酶等参与抗病胁迫。qRT-PCR结果表明，5个候选基因的表达模式呈显著性差异，itf02g20100在接种3

d时表达量达到峰值，是对照的6.2倍；

itf02g19880在接种0.5d后表达量急剧上升至最高达到对照的43.2倍；itf13g18480

和itf13g18550的表达模式相似，均在接种7d时达到峰值。表明不同候选基因在甘薯茎线虫侵染后的防御响应中可能发挥

不同的调控作用。【结论】定位到3个与甘薯抗茎线虫病相关的QTL，筛选出36个相关候选基因。

关键词：甘薯；F1群体；抗茎线虫病；QTL定位；候选基因

QTLAnalysisforResistancetoStemNematodeDiseaseinSweetpotato

ZHAODongLan,MAJuKui,XIAOShiZhuo,ZHOUZhiLin,ZHAOLingXiao,WANGJie,DAIXiBin,

SUNHouJun,CAOQingHe

XuzhouInstituteofAgriculturalSciencesinJiangsuXuhuaiDistrict,Xuzhou221131,Jiangsu

Abstract:【Objective】Thepurposeofthisstudywastoanalyzethequantitativetraitloci(QTLs)relatedtostemnematoderesistance

insweetpotato(Ipomoeabatatas(L.)Lam.),layafoundationforthefinemapping,cloning,andfunctionalanalysisofstemnematode

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