2019年吃“基”丨多篇15分文章剖析爆款甲基化修饰（DNA-RNA-蛋白）研究思路.pdfVIP

2019年吃“基”丨多篇15分文章剖析爆款甲基化修饰

（DNA-RNA-蛋白）研究思路

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9月11日，2018年拉斯克奖（“诺奖风向标”）结果公布，加

州大学的MichaelGrunstein和洛克菲勒大学的C.DavidAllis共同分

享了今年的基础医学研究奖。获奖理由是发现并阐释了组蛋白化学修

饰对基因表达的影响。其中，甲基化修饰是组蛋白化学修饰中一种比

较常见的修饰，近几年的新生力量RNA甲基化更是把甲基化修饰家族

带到了一个新的高度。限于篇幅，本文先分享RNA甲基化修饰的完整

研究思路，后续再解读DNA、蛋白质的甲基化修饰研究思路。

最近几年，关于RNA甲基化的研究，热度逐渐抬高（见图1）。

这个热点早在2015年就已经在《Nature》和《Cell》上发表了相关研

究结果。

图1.m6A发表数量10年趋势图。2018年预计全年文章至少240

篇，相比2017年增长94%，大约20篇/月的暴走节奏。2017年文章

数量比2016年增长44%。

另外，2016年中标的国自然中m6A的项目数是5个，2017年有

22个；2018年增加到了60个左右，增加到了近3倍，经费达到了近

3000万。预计2019年中标的项目数会超过100项，经费级别达到

5000万。m6A已然成为中国科研界的“明日之星“。

图2.百度搜索“RNA甲基化”结果有百万条

那么，RNA甲基化到底是什么？有哪些过人之处？有哪些研究工

具可使用？有哪些研究套路可参考？

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RNA甲基化是什么？有哪些过人之处？

已知RNA存在超过100种修饰，mRNA最常见的内部修饰包括

N6-腺苷酸甲基化（m6A）、N1-腺苷酸甲基化（m1A）、胞嘧啶羟

基化（m5C）等。RNA甲基化修饰约占所有RNA修饰的60%以上，

而m6A是高等生物mRNA和lncRNAs上最为丰富的甲基化修饰。研

究发现，microRNA、circRNA、rRNA、tRNA和snoRNA上都有

m6A修饰的发生。

m6A英文全称是N6-methy-ladenosine，N6-甲基腺嘌呤，是

一种动态可逆的修饰方式。如图3，m6A是指碱基A第6位N原子上

的甲基，主要存在于mRNA的CDS区和3’UTR区。m6A在转录后

调控中发挥重要作用，影响mRNA的稳定性，翻译效率，可变剪接，

RNA的转运和衰变等。m6ARNA出现在多种重要的细胞生命过程中，

意味着mRNA甲基化参与了多种生物学过程，一旦参与m6A修饰的

酶出现异常，将会引起很多疾病，包括肿瘤、神经性疾病、代谢性疾

病、胚胎发育迟缓等。

图3.m6ARNA修饰及介导的功能（图片来自网络）

类似于DNA甲基化、组蛋白甲基化修饰受一些编写酶（Writers）

和去除酶（Erasers）（1，2）的调控，m6A修饰主要受去甲基化

酶、甲基化酶和甲基化识别酶等调控，即由“编码器”（Writer）、

“读码器”（Reader）及“消码器”（Eraser）协同起作用。

图4.人m6A修饰酶的编码器、读码器和消码器的结构域

（图片来自MihyeLeeetat(2014)Cell,158:980）