生物信息学生物信息数据库及其信息检索.ppt

生物信息学生物信息数据库及其信息检索演示文稿;生物信息学生物信息数据库及其信息检索;本章主要内容;生物信息学数据库的地位和作用;生物信息学数据库类型;生物信息学数据库类型;GooglevsBaidu;一、序列数据库;核酸序列数据库

GenBank（/Genbank）

EMBL（http://www.ebi.ac.uk/embl/）

DDBJ（http://www.ddbj.nig.ac.jp/）

三个数据库每天互相交换数据

GenBank可通过NCBI的检索系统Entrez获取，Entrez集成来自主要DNA和蛋白序列数据库的数据，包括物种、基因组、定位、蛋白结构和结构域等信息

其他各种专业核酸数据库

非冗余参考序列数据库RefSeq

密码子使用数据库CodonUsageDatabaseCUTG

基因可变剪接数据库ASDB

转录因子数据库TRANSFAC;NCBI(NationalCenterofBiotechnologyInformation）

美国国立生物技术信息中心;三大数据库之间的联系;ATTGACTA;GenBank中测序最多的20个物种;human;;蛋白质序列数据库

UniProt（）

由Swiss-Prot、TrEMBL和PIR蛋白质数据库联合构建，提供蛋白质序列和功能注释的核心资源。由三个子库组成：（1）UniProtK