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分子植物育种，2025年，第23卷，第8期，第2591-2598页

MolecularPlantBreeding,2025,Vol.23,No.8,2591-2598

研究报告

ResearchReport

青甘韭cpSSR序列特征分析

1111,2*

曲桑卓玛田甜李文麒王宏霞

1青海民族大学生态环境与资源学院,西宁,810007;2青海民族大学,青海省特色经济植物高值化利用重点实验室,西宁,810007

*通信作者,zj511102365@163.com

摘要为明确青甘韭cpSSR序列的特征，本研究通过IlluminaNovaSep高通量测序技术对叶绿体基因组

进行测序，使用MISAv1.0软件对叶绿体基因组微卫星进行搜索分析，Primer3软件对所获得的cpSSR序列

进行聚合酶链式反应(PCR)引物设计。结果显示，在青甘韭153509bp叶绿体基因组序列上共检测到255个

SSR位点，平均每602bp出现一个cpSSR重复序列，共有6种类型，其中单碱基数量最多，占比67.42%，其

次是三碱基(23.11%)，六碱基最少，仅占0.38%。微卫星长度区间为8~25bp，主要在8~10bp(75.29%)，其中

长度在20bp及以上的有8个