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高通量测序质量管理持续改进方案

一、方案适用范围与改进目标

本方案适用于illumina测序平台（NovaSeq、NextSeq、MiSeq）、MGI测序平台（DNBSEQ-T7、DNBSEQ-G400）的全流程质量管理，覆盖样本接收、文库制备、上机测序、下机数据拆分、生物信息分析全环节，针对病原微生物测序、肿瘤基因测序、全基因组重测序、转录组测序等全部应用场景。

核心改进目标为：3个月内样本不合格检出率提升至99.5%以上，文库制备成功率提升至98%以上，Q30占比稳定保持在90%以上（GC含量40%-60%样本），数据比对率提升至95%以上，数据交付周期达标率提升至99%以上，用户数据质量投诉率降至0.1%以下；6个月内实现全流程质量异常溯源响应时间小于2小时，偏差纠正措施有效率达到100%。

二、全流程质量节点精细化管控标准

（一）样本接收与预处理环节

1.样本类型准入与阈值标准

游离DNA样本：浓度≥0.5ng/μL（Qubit荧光定量检测），总量≥10ng，片段分布主峰在160-180bp，无高分子量gDNA污染（琼脂糖凝胶电泳检测无大于1000bp条带，或毛细管电泳下高分子量片段占比5%）；

基因组DNA样本：浓度≥10ng/μL，总量≥1μg，OD260/280比值1.8-2.0，OD260/230比值2.0-2.2，琼脂糖凝胶电泳主带清