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第  卷 第 期                             化 学 进 展 
   19      4                                                                     VoI . 19  No .4 
     年 月                                                                               , 
2007   4                           PR0GRESS  IN  CHEMISTRY                         Apr . 2007 
              化学信息学与生物信息学开放性比较 
                                       ! 
                               乔园园  鹿 涛 车云霞 
                               (南开大学化学学院 天津 30007 1) 
    摘 要 通过对化学信息学与生物信息学在公共资源、数据文件格式、软件编程语言、科学文献与教材 
等诸方面的比较与分析,指出生物信息学的成功因素在于其开放性;与之相比,虽然高等学校、研究所等教育 
科研领域和商业公司(特别是药物研发公司)都发布了不少化学信息学开源或自由软件以及一些开放数据, 
但化学信息学仍然由于各种原因使得开放性不足。有鉴于此,国内建立了化学化工资源导航系统,启动了 
《计算化学e-science 研究及示范应用》等国家自然科学基金重大项目。在教育、教学方面也应继续改革,使化 
学信息学能真正适应和促进当前药物发现研究。 
    关键词 化学信息学 生物信息学 开放性 药物发现 
    中图分类号:           ;     ;         文献标识码:  文章编号:                    (  ) 
                06-39 TP311  R914 . 2            A            1005-281X 2007 04-0624-09 
      Comparison  of  Openness Between  Chemoinformatics  and Bioinformatics 
                               Oiao  Yuanyuan ! Lu  Tao Che  Yunxia 
                    (                ,              ,             ,     ) 
                     CoIIege  of  Chemistry Nankai  University Tianjin 30007 1 China 
    Abstract By  the  comparisons  between  chemoinformatics  and  bioinformatics  on  such  aspects  as  pubIic  resources , 
data formats ,programming Ianguage ,Iiteratures and textbooks ,it is cIear that ,openness is the success for 
           , 
bioinformatics but  it  is the shortness for chemoinformatics though Iaunched earIier .  Besides a number of  open sources or 
free  appIications and  open  databases for chemoinformatics from academia and industry , 
                                                                   there is stiII  a huge gap unfiIIed . 
         , 
In  addition the  reformation  in  teaching  system  shouId  be  continued  in  order  to  catch  up  with  the  rapid  paces  of
                
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