化学信息学与生物信息学开放性比较.pdfVIP

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第 卷 第 期 化 学 进 展 19 4 VoI . 19 No .4 年 月 , 2007 4 PR0GRESS IN CHEMISTRY Apr . 2007 化学信息学与生物信息学开放性比较 ! 乔园园 鹿 涛 车云霞 (南开大学化学学院 天津 30007 1) 摘 要 通过对化学信息学与生物信息学在公共资源、数据文件格式、软件编程语言、科学文献与教材 等诸方面的比较与分析,指出生物信息学的成功因素在于其开放性;与之相比,虽然高等学校、研究所等教育 科研领域和商业公司(特别是药物研发公司)都发布了不少化学信息学开源或自由软件以及一些开放数据, 但化学信息学仍然由于各种原因使得开放性不足。有鉴于此,国内建立了化学化工资源导航系统,启动了 《计算化学e-science 研究及示范应用》等国家自然科学基金重大项目。在教育、教学方面也应继续改革,使化 学信息学能真正适应和促进当前药物发现研究。 关键词 化学信息学 生物信息学 开放性 药物发现 中图分类号: ; ; 文献标识码: 文章编号: ( ) 06-39 TP311 R914 . 2 A 1005-281X 2007 04-0624-09 Comparison of Openness Between Chemoinformatics and Bioinformatics Oiao Yuanyuan ! Lu Tao Che Yunxia ( , , , ) CoIIege of Chemistry Nankai University Tianjin 30007 1 China Abstract By the comparisons between chemoinformatics and bioinformatics on such aspects as pubIic resources , data formats ,programming Ianguage ,Iiteratures and textbooks ,it is cIear that ,openness is the success for , bioinformatics but it is the shortness for chemoinformatics though Iaunched earIier . Besides a number of open sources or free appIications and open databases for chemoinformatics from academia and industry , there is stiII a huge gap unfiIIed . , In addition the reformation in teaching system shouId be continued in order to catch up with the rapid paces of

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