油菜A9染色体的标记、基因和结构变异.docVIP

  油菜 A9 染色体的标记、基因和结构变异# 刘忠松1，王卓2，刘显军1，谭勇俊1，陆赢1，官春云1* （1. 湖南农业大学油料作物研究所，长沙 410128； 5 10 2. 湖南农业大学生物科学技术学院，长沙 410128） 摘要：油菜 A9 染色体是 A 基因组最长的一条染色体，控制着许多重要性状。本文确定了 A9 染色体上 252 个 DNA 标记、180 个 BACs 和 150 多个拟南芥同源基因的排列顺序和同线关系， 发现了没有标记或标记很少的染色体区域，认为这些区域可能处于难以交换的 A9 染色体着 丝粒附近，在由白菜通过杂交形成异源四倍体甘蓝型油菜和芥菜型油菜的过程中 A9 染色体 着丝粒区域发生了显著的结构重排。这些结果为油菜 A9 染色体的序列组装、基因发掘和分 子育种提供了基础。 关键词：油菜；A9 染色体；分子标记；细菌人工染色体文库 中图分类号：S565.4 15 DNA Markers, Arabidopsis Orthologous Genes and Structural Variation Liu Zhongsong1, Wang Zhuo2, Liu Xianjun1, Tan Yongjun1, Lu Ying1, Guan Chunyun1 20 25 30 35 (1. Oilseed Crops Institute,Hunan Agricultural University,Changsha 410128; 2. College of Bioscience and Biotechnology,Hunan Agricultural University,Changsha 410128) Abstract: The A9 chromosome is the longest among the 10 A-genome chromosomes of Brassica species. and controls so many major characters. The 252 DNA markers, 180 BACs and over 150 Arabidopsis orthologous genes were arranged in order on the A9 chromosome and their synteny was established. The chromosomal segment with few or no markers was found and proposed to be located around the centromere of the chromosome. The centromere region of the A9 chromosome has undergone a major structural rearrangement during the formation of the allotetraploid Brassica napus and B. juncea through the interspecific hybridization with the ancestral species B. rapa. These findings will provide the foundations for sequence assembly, mining and molecular breeding of genes on the A9 chromosome. Key words: Brassica; A9 chromosome; DNA markers; BACs 油菜是重要的油料作物，包括白菜型、芥菜型和甘蓝型三种类型，白菜型油菜是二倍体， 由白菜演化而来，芥菜型油菜是由芥菜演化而来，但它是白菜和黒芥杂交产生的异源四倍体， 甘蓝型油菜也是白菜与甘蓝杂交产生的异源四倍体（图 1），所以这三种类型的油菜具有共 同的白菜来源的 A 基因组。 基金项目：教育部博士点专项科研基金项目（200805370003）；湖南省研究生科研创新基金（CX2010B307) 作者简介：刘忠松（1963-），男，教授，油菜分子育种. E-mail: zsliu48@ -1- 图 1 芸薹属植物起源的禹氏三角关系  40 45 50 注：A、B 和 C 代表基因组，n 代表配子染色体数目，x 代表倍性， Mb 代表百万碱基对，♂和♀代表父母本。 A 基因组包含 10 条染色体，其中 A9 染色体是最长的染色体，有人把它称为 1 号染色 体，Kim 等[1]用 KBrH143F19 和 KBrH143K20 2 个 BAC 进行