基于线粒体细胞色素b 基因序列分析的泉水鱼遗传多样性研究.pdfVIP

6 广东农业科学 2012 年第 1 期 基于线粒体细胞色素b 基因序列分析的 泉水鱼遗传多样性研究 司从利 章 群 马 奔 黄小彧 黎瑞宝 乐小亮 暨南大学水生生物研究所袁广东 广州 510632冤 摘要 测定了长江水系贵定和乐山 2 个群体 30 尾泉水鱼细胞色素 b 基因 1 026 bp 序列袁发现 13 个变异位点袁检测出 7 种 单倍型袁Hd 和 Pi 分别为 0.772 和0.0041 袁其中贵定和乐山群体的 Hd 分别为 0.695 和 0.362袁Pi 分别为 0.0030 和 0.0004 袁呈现出单 倍型多样性较低和核 酸多样性极低的特点曰 两个群体间的 Fst 和 Nm 值分别为0.7417 和0.17 袁A MOVA 分析显示遗传变异主要 集中在群体间 (74.17%) 袁表明群体间出现高度的遗传分化曰在邻接树上出现两个按地理来源聚群谱系袁呈现出明显的地理结构曰估 算群体间分歧时间大约在 16 万年前袁为更新世时期遥中性检测表明两个群体在过去没有发生种群的快速扩张遥建议将贵定和乐山 群体作为不同的管理保护单位加以保护遥 关键词 泉水鱼曰 细胞色素 b 曰 遗传多样性 + + 中图分类号 Q343.3 5曰Q346 .5 文献标识码 A 文章编号 1004-874X 2012冤01-0006-03 Genetic diversity of Pseudogrincheilus procheiluys based on mitochondrial cytochrome b sequence analysis S I Cong-li, ZHANG Qun, MA Ben, HUANG Xiao-yu, LI Rui-bao, YU E Xiao-liang Institute of Hydrobiology, Jinan Univ ersity, Guangzhou 510632, China冤 Abstract: 1 026 bp sequences of mitochondrial DNA cytochrome b gene of 30 individuals from 2 populations of Pse udogrincheilus procheiluys collected in Guiding and Leshan from the Yangtze River drainage respectively were sequenced, totally 13 variable sites were found in 7 haplotypes, the global haplotype diversity (Hd) and nucleotide diversity was 0.772 and 0.0041 respectively, the haplotype diverisity in Guiding and Leshan populations were 0.695 and 0.362 respectively, their nucleotide diversity were 0.0030 and 0.0004 respectively, indicating a pattern of low haplotype diversity and