凝胶图像分析软件BandScan操作手册.pdfVIP

胶图像分析软件BandScan 操作手册 胶图像分析软件BandScan 操作手册 Edited by 张晓舟（ ）2004-11-14 1、安装软件BandScan 5.0，并按照说明破解以消除使用时间限制。 2、安装好以后就会在桌面上出现BandScan 的图标，双击打开。 3、打开后的界面如下图。 4、打开一张扫描好的电泳图。BandScan 可以识别TIF 和JPG 格式的图片，很方便。打开工具栏 上的f ile/open tiff, j pg f ile format，选中待分析的图片。 5 打开待分析图片。这时候凝胶图像显示出来。1 道是低分子量标准，2 道是诱导表达的蛋白，3 道是未诱导的对照。旁边有一个图像预览窗 Image Preview，可以看到，除了cancel，其它 命令框都是灰色的（不可操作）。其实这里是要你先选定一个图像处理的范围（select rectangle）。 6 从凝胶图左上角按住鼠标左键划到右下角，松开鼠标，划出的长方形框包扩了整个待分析的范 围。这时，命令框内均变成黑色的（可以操作）。上面那个undo rect 可以取消选框，下面的image options 可以选择是否和如何旋转图像。本例中均不改动，直接单击accept selected region 。 7 出现color to signal selections 复选框。这个是选择信号检测方式，直接用默认的original image， 或选择gray scale （灰阶）。本例中不改动，单击use current image。 8、出现如下分析框。它是自动转换成灰阶的。其左上角的数字是鼠标所在的坐标和灰度值。移动 鼠标就可以看到它的变化。 9、现在让BandScan 来分析一下电泳条带吧：打开工具栏上的band f inding/f ind bands，出现一 个让你选择有几条泳道的框selecting number of lanes，我们设置成3 道。 10 看，每一个条带都自动被框起来了！红色+记号是条带的中心 置，兰色竖线是泳道 置。同 时出现了一个复选框select more or select few bands。可以根据总灰度 最大灰度和大小为 标准来自动选择蛋白条带。拉动左边的滚动条，可以增加或减少条带的数量。选好后单击ok 。 11、现在就可以看看蛋白的表达量了：打开window/band table。出现了一个band location 的表 格。把它最大化，放到右边。这里的数据是每个条带的中心 置（红色+的 置）。 12、在band location 的数据类型data type 中，选择percent signal，就会出现各个条带灰度值占 本泳道条带总灰度值的百分比。 13 单击自己的表达条带，则条带中心的+和相应的百分数的背景都会变成绿色。我表达的融合蛋 白约占细菌总蛋白的29.8%。我们要的数据就得到了。自己再重复一下整个过程，会发现， 原来是如此简单！ 14 BandScan 绝不仅仅是这么简单，它还可以做很多事情。比如通过设定一个条带的量 （标准） 来推断表达蛋白的量。比如用手动方式加入未被自动选择的条带，等等。举个例，我们发现 我的目的条带上面有几个浅条带没有被选上，可以用band f inding/manually insert a band 命 令把它们选上。这时，条带百分数也会随之改变。