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美好明日 美好未来
细胞/动物组织基因组 DNA 纯化方法
1. 细胞基因组 DNA 提取方法
1. 贴壁细胞用胰酶消化,离心收集。
2. 细胞重悬于冰冷的 PBS 漂洗一次,离心收集。
3. 重复 2 。
4. 加入 5ml DNA 提取缓冲液,(10m mol/L Tris-cl, 0.1 mol/L EDTA, o.5% SDS),混匀。
5. 加入 25ul 蛋白酶 K ,使终浓度达到 100ug/ml, 混匀,50℃水浴 3h,
6. 用等体积的酚抽提一次,2500r/min 离心收集水相,
用等体积的(酚,氯仿,异戊醇)混合物抽提一次,2500r/min 离心收集水相。
用等体积的氯仿,异戊醇抽提一次。
7. 加入等体积的 5mol/L 的LiCL,混匀,冰浴,10min.
8. 2500r/min,离心 10min. 转上清与一离心管中。加入等体积的异丙醇。室温 10 分钟。
9. 2500r/min,离心 10min。弃上清。
加入 0.1 倍 体积 3mol/L 乙酸钠(PH5.2)与 2 倍体积-20℃预冷无水乙醇。-20℃ 20 分钟。
10. 12000r/min, 室温离心 5 分钟。弃上清。将 DNA 溶于适量 TE 中。
2. 动物组织基因组 DNA 提取方法
在许多 DNA 研究工作中,需要直接从新鲜或冻存的动物组织(如肝、脑、肺、鼠尾等)中制备高分子量 DNA 。
与提取细胞基因组 DNA 相似,操作前应确定需处理的动物组织样品最大量,以免造成组织裂解不彻底及 DNA 得量和
纯度的下降。与培养细胞相比,从动物组织制备 DNA 更为困难。动物组织难以破碎,用一般匀浆方法捣碎组织容易
引起 DNA 断裂,而且时间比较长,在此期间 DNA 可能会被 DNA 酶降解,因此用一般方法难以从动物组织中大量制
备高分子质量的基因组 DNA 。
2.1 操作步骤:
1. 切取组织 5g左右,剔除结缔组织,吸水纸吸干血液,剪碎放入研钵(越细越好)。
Notice :常规动物组织样品的处理方式和注意事项
新鲜组织:刚刚离体的新鲜动物组织 25mg (小鼠尾0.6-1.2cm,大鼠尾 0.6 cm )用剪刀剪切成小块,移入预冷的
研钵或匀浆器中,快速、用力研磨或匀浆
冻存组织:不能立刻提取 DNA 的组织样品应置于液氮或-70 度冰箱中保存并避免反复冻融。取出冻存样品,放
入预冷的研钵或匀浆器中,加入少许液氮快速、用力研磨成粉末状。
需要特别注意的部分组织样品:
某些组织样品因匀浆比较困难或匀浆过程中 DNA 容易降解,建议无论新鲜组织,还是冷冻保存的样品,都
应按照冻存组织样品的处理方式进行
2. 倒入液氮,磨成粉末,加 10ml分离缓冲液。
3. 加 1ml 10% SDS,混匀,此时样品变得很粘稠。
4. 加 50ul或 1mg 蛋白酶 K , 37 ℃保温 1-2 小时,直到组织完全解体。
5. 加 1ml 5mol/L NaCl,混匀,5000rpm离心数秒钟。
6.取上清液于新离心管,用等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提。待分层后,3000rpm离心 5 分钟。
7. 取上层水相至干净离心管,加 2 倍体积乙醚抽提(在通风情况下操作)。
8. 移去上层乙醚,保留下层水相。
9. 加 1/10 体积 3mol/L NaAc,及 2 倍体积无水乙醇颠倒混合沉淀DNA。室温下静止 10-20 分钟,DNA沉淀形成
白色絮状物。
北京明日百傲生物科技发展研究所 01062819319
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10. 用玻棒钩出DNA沉淀,70%乙醇中漂洗后,在吸水纸上吸干,溶解于 1ml TE中,-20℃保存。
11. 如果DNA溶液中有不溶解颗粒,可在 5000rpm短暂离心,取上清
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