系统生物学研究进展C.pdfVIP

院刊 学科发展 系统生物学研究进展 杨胜利 （ 上海生物工程研究中心 上海 ） 摘要 人类基因组计划把生物学由分子生物学时代推向系统生物学时代，生物学由分解转向整 合，由叙述科学转变为定量预测科学。 关 键 词 系统生物学，组学，计算生物学 世纪生物学经 系统生物学的组学技术平台 历了由表及里、由宏观 随着基因组测序的进展，科学家逐步将目光集 到微观的发展历程，人 中到功能基因组研究。在基因组水平研究基因的表 们对生物体的认识也 达及其调控、基因及其产物的结构与功能、分子的 逐步由表型深入到分 相互作用、基因型与表型的相关性，推动了一系列 子层次。但生物体是一 基因组水平的测试技术平台，主要有基因组学、转 个复杂系统，只有通过 录组学、蛋白质组学、代谢组学、相互作用组学和表 各种分子机制、途径和 型组学等，这些高通量的组学实验平台构成了系统 网络的整合才能全面、 生物学的大科学工程。 系统地阐明复杂的生 基因组学 物学现象。 年启动的人类基因组计划是生命科 基因组学包括基因组测序、基于单核苷酸多态 学史上第一个大科学工程，该计划是生物学发展的 性的基因分型、表观基因组学等技术平台。 一个重要转折点，使研究工作由分解转向了整合， 基因组测序揭示了每一个生物体中所有的遗 研究的构架也由单一的生物学实验室转变为大科 传密码，是系统生物学的基础和起点，因为基因组 学工程与传统生物学实验室相结合的模式。生物学 的序列决定了每一个生物体的基本性状，并与环境 与数学、物理、计算机科学将更紧密地交叉，使生物 因子相互作用决定生物体的行为。 年已完成了 学由描述性科学发展为定量预测的科学。在人类基 人类基因组计划中人和 种模式生物的全基因组 因组计划带动下出现的一系列组学（ ），逐步 测序，同时也完成了多种重要动、植物品种和 把分子生物学时代推向系统生物学时代。 多种病原微生物和工业微生物基因组的测序。 系统生物学是在细胞、组织、器官和生物体整 基因分型的精度已达单个核苷酸水平， 年