环境16S rDNA和16S rcDNA序列分析湖光岩玛珥湖的浮游细菌组成.pdfVIP

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第 33 卷 第 3 期 广东海洋大学学报 Vol.33 No.3 2013 年 6 月 Journal of Guangdong Ocean University Jun. 2013 环境 16S rDNA 和 16S rcDNA 序列分析湖光岩 玛珥湖的浮游细菌组成 1 1 1 1 1 1,2 秦青英 ,曾永辉 ,郭倩茹 ,简纪常 ,鲁义善 ,吴灶和 (1. 广东海洋大学水产学院广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室,广东 湛江 524088 ; 2. 仲恺农业工程学院,广东 广州 510000 ) 摘 要:通过提取环境总 16S rDNA 和总 16S rRNA 分别构建 DNA 克隆文库和反转录 cDNA 文库,并进行克隆测序 和序列分析,探讨湖光岩玛珥湖浮游细菌和浮游活性细菌的遗传多样性。结果表明:构建两个水层的 4 个克隆文库, 即 1 m 和 10 m 水层总菌的 16S rDNA 文库和总活性菌的 16S rcDNA 文库,共获得 413 条序列,分属 15 门、32 目、 52 科;1 m 水层的 rDNA 文库与 rcDNA 文库中 Verrucomicrobia 类群所占比例最大(36.8%和 32.1%),其次为 Alphaproteobacteria(15.1%和 16%)和 Betaproteobacteria(17.9%和 16%);在 10 m 水层的 2 个文库中,Alphaproteobacteria 类群均占绝对优势,分别为 63.5%(rDNA)和 43.8%(rcDNA),其次为 Verrucomicrobia(11.5%和 14.3%),其他细 菌类群包括 Acidobacteria、Chloroflexi、Firmicutes、待定门 OD1、Planctomycetes 、Spirochetes 和 Deltaproteobacteria, 比例在 0.8% ~ 3.8%之间;在科的水平上,SAR11 为湖光岩玛珥湖最为丰富的类群,占总克隆数的 26.9%,其中在 10 m 水层的比例高达 51.5%。序列同源性分析表明,绝大多数序列(89.8%)来源于新种,其中 19.6%的序列可能 来自于新属,69%的序列可能来自于全新的科。湖光岩玛珥湖浮游细菌群落结构较为独特,有大量的浮游细菌种类 尚未获得相应的纯培养物,蕴含着丰富而新颖的微生物资源。 关键词:湖光岩玛珥湖;浮游细菌;浮游活性菌; 16S rDNA;16S rRNA;系统发育分析;遗传多样性 中图分类号:Q939.19 文献标志码:A 文章编号:1673-9159 (2013 )03-0001-09 Bacterioplankton Composition in Huguangyan Maar Lake Revealed by Environmental 16S rDNA and 16S rcDNA Sequence Analysis QIN Qing-ying1 1 1 1 1 1, 2 , ZENG Yong-hui , GUO Qian-ru , JIAN Ji-chang , LU Yi-shan , WU Zao-he (1. Guangdong Provincial Key Labo

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