基于全基因组的芽孢杆菌平均核苷酸同源性（ANI）分析.docVIP

基于全基因组的芽孢杆菌平均核苷酸同源性（ANI）分析 胡桂萍 刘波* 唐唯其 福建省农业科学院农业生物资源研究所，福建省福州市，350003 摘要 采用Jspecies软件分析芽孢杆菌属及近缘种芽孢杆菌全基因组之间平均核苷酸同源性（ANI）的特征性。结果表明，芽孢杆菌属及种间两两菌株间ANI的具有明显属种特异性，其中芽孢杆菌科不同属之间的ANI值均低于70%或者同源基因相似性差异超过50%；芽孢杆菌属内种间ANI值均低于95%，幅度范围广，为93.81%到63.77%，大部分位于64.77%和68.4%之间，加权平均数为70.12% 可作为种分类的一个标准；芽孢杆菌亚种内ANI值均高于95%，分布范围从95.5%到99.97%，其分布存在三种类型，并与其系统发育进化遗传亲缘关系相关。同时基因组中的四核苷酸（Tetra）回归系数与ANI值具有相关性，表现明显种特征性，回归拟合显示两者呈现一元二次方程关系，（R2=0.9812），同时高于70的ANI值与相应的Tetra回归系数呈线性正相关，方程式为（R2=0.8767）。 关键词 芽孢杆菌，系统发育，平均核苷酸同源性，Jspecies Characteristic of average nucleotide identity from Bacillus genus based on the whole genome Hu Gui-p