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川芎根际土壤微生物多样性 PCR-DGGE 分
析#
吴清华,王光志,李萍**
5
10
15
20
25
30
35
40
(成都中医药大学药学院,成都 611137)
摘要:目的:研究不同栽培地川芎根际土壤真菌和土壤细菌多样性差异。方法:提取土壤微
生物总 DNA,利用特异性引物,PCR-DGGE 扩增,采用 Shannon-Wienner 指数和 Simpson
指数评价微生物多样性,采用聚类分析比较相似性。结果:成功提取了川芎根际土壤微生物
总 DNA,并进行了 PCR-DGGE 多样性研究。结论:不同栽培地区,川芎根际土壤细菌和真
菌多样性差别较大,川芎苓种繁育地土壤微生物多样性较药材栽培地差别明显。
关键词:药用植物学;川芎;根际土壤;微生物多样性;细菌;真菌
中图分类号:R282.2
Microbial Communities Diversity in Rhizeosphere Soils of
Ligusticum Chuanxiong Hort. by PCR-DGGE
WU Qinghua, WANG Guangzhi, LI Ping
(Pharmacy school of Chengdu University of TCM, Chengdu 611137)
Abstract: Objective: To study the diversity differences of microbial communities in rhizeosphere soils
from different habitats of Ligusticum Chuanxiong Hort. Methods: Microbial total DNA was extracted
by DNA extraction kit and amplified by PCR-DGGE. Diversity differences of microbial communities
were analyzed by Shannon-Wienner index and Simpson index. Cluster analysis was used to analyze
DNA similarity. Result: Microbial total DNA in rhizeosphere soils from different habitats of
Ligusticum Chuanxiong Hort. were extracted and microbial communities diversity were studied by
PCR-DGGE. Conclusion: The diversity of rhizeosphere bacteria and fungal from different habitats
were different.
Key words: Medicinal plant ; Ligusticum Chuanxiong Hort. ; Rhizeosphere Soils ; Microbial
Communities Diversity;Bacterials;Fungal
川芎来源于伞形科植物川芎(Ligusticum Chuanxiong Hort.)的干燥根茎[1],其性温,味
辛,具有活血行气、祛风止痛之功效,广泛用治月经不调、经闭痛经、癥瘕腹痛、胸胁刺痛、
跌扑肿痛、头痛、风湿痹痛等症,被称之为“血中气药”。现代研究表明,川芎根茎含阿魏
酸、川芎嗪、4-羧基-3-丁基酜内酯、川芎内酯等成分。川芎在四川有悠久的栽培历史,为著
名的川产道地药材[2]。成都平原金马河流域的都江堰、彭州等地是川芎药材的主要栽培地,
盆地边缘海拔较高的彭州白水河、小鱼洞,都江堰青城山,汶川水磨镇等地是其苓种的主要
繁殖地。2008 年汶川地震对川芎药材栽培地与苓种繁殖地土壤均造成了极大影响,研究表
明[3],地震前后川芎根际土壤真菌、细菌和放线菌的数量变化较大,土壤功能菌群落多样性、
均匀性在震后均呈现先降低,后逐步回升的趋势。
由于根际是植物、土壤和微生物相互作用的重要界面,也是物质和能量交换的结点,根
际土壤微生物的群落结构与多样性对植物根际微生态环境的稳定,养分的供给,植物的
基金项目:国家自然科学基金资助项目,教育部博士点基金资助项目(200951320002)
作者简介:吴清华(1986-),女,助教,主要研究方向:中药资源持续利用
通信联系人:王光志(1976-),男,副教授,研究方向:中药资源持续利用. E-mail: kzwon@163.com
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