生物信息学在蛋白质组学上的应用.pdfVIP

安徽农业科学 ,Journal of Anhui Agri . Sci . 2006 ,34 (23) :6142 - 6144 　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　责任编辑 　庆 　责任校对 　庆 生物信息学在蛋白质组学上的应用 ( ) 黄 啸　 中国药科大学生命科学与技术学院 ,江苏南京 210009 摘要　蛋白质组学是后基因时代标志性的研究新领域 ,其快速发展很大程度上依赖于生物信息学的蓬勃壮大 。从生物信息学与蛋白质 数据库、蛋白质分析、蛋白质功能的联系3 个方面 ,对生物信息学在蛋白质组学上应用的研究进展进行综述 。 关键词　生物信息学;蛋白质组学;蛋白质数据库;蛋白质分析;蛋白质功能 ( ) 中图分类号　Q 51 　　文献标识码　A 　　文章编号　0517 - 6611 2006 23 - 6142 - 03 Application of Bioinformatics in Proteomics ( ) HUANG Xiao 　 School of Life Science and Technology , China Pharmaceutical University , Nanj ing , Jiangsu 210009 Abstract 　Proteomics is a new symbolic research field of the postgenomic time . Its rapid development depends heavily on the dynamic growth of bioin formatics. Recent advances in the application of bioinformatics in proteomics were discussed from three aspects : protein databases , protein analysis ansd protein function . Key words 　Bioinformatics ; Proteomics ; Protein database ; Protein analysis ; Protein function 　　随着信息时代的迅猛发展 ,软硬件的快速更新 ,生物信 蛋白质组中蛋白质的数 目有时可以超过基因组的数 目。蛋 息学这一新型学科得以蓬勃壮大 ,为后基因组时代的研究提 白质组学是研究蛋白质组及大范围蛋白质的分离 、分析 、应 供了更快、更新、更准确的研究手段 。相比于在基因组时代 , 用的学科 。它不同于传统的单个蛋白质或某一类蛋白质研 蛋白质组比基因组更加复杂 ,更具有挑战性 ,更迫切需要生 究 ,研究体系内全部的蛋白质及其动态变化规律 。早期蛋 物信息学提供大量有序的数据 。因此 ,发展生物信息学对蛋 ( 白质组学的研究范围主要是指蛋白质的表达模式 Expres 白质组学的数据进行搜选 、处理和应用必将成为现代生物信 sion profile) , 随着学科的发展 ,蛋白质组学的研究范围也在 息学发展的必然趋势 。 不断完善和扩充 。蛋白质翻译后修饰研究已成为蛋白质组 1 　生物信息学、蛋白质组学的相关概念 研究中的重要部分和巨大挑战 ,蛋白质间相互作用的