丙型肝炎病毒基因分型与临床分子诊断.pdfVIP

分子诊断与治疗杂志 2010年9月第2卷第5期 JMolDiagnTher,September2010．Vo1．2No．5 ．289． · 述 评 · 丙型肝炎病毒基因分型与临床分子诊断 张太松 李明 【摘 要】 丙型肝炎基因分型对于分子流行病学研究、预测慢性丙型肝炎病情和抗病毒治疗效果具有 重要的意义。本文就近年来丙型肝炎基因分型的意义、方法和临床应用情况作简要述评。 【关键词 】丙型肝炎病毒；基因分型；分子诊断 GenotypingofhepatitisCvirusinclinicalmoleculardiagnostics ZHANGTaisong，LIM ing (DaAnGeneDiagnosticCenterofSunYat—senUniversity,Guangdong，Guangzhou510665，China) [ABSTRAC-r] GenoytpingforhepatitisCvirusiswidelyusedofrmolecularepidemiologicalsurvey, predictingtheclinicaloutcomeofchronicHCV infectionandhteresponsetoantiviraltherapy．Thepresentarticle aimstoreview hteclinicalsignificance，methodsandapplicationofHCV genotyping． K【EYWORDS】HepatitisCvirus(HCV)；Genotyping；Moleculardiagnostics 丙型肝炎病毒 (hepatitisCvirus，HCV)是引起输 NS2区 NS1／E2、El3’UTR区 【。 血后非 甲非乙型肝炎的主要病原体，据世界卫生组织 5UTR区的序列最为保守，种系变化程度及进化 (WHO)估计，全世界HCV感染率平均约为3％，而 率都很低 】，可用于区分主要基因型，但 1型和6型 且每年仍有 300万~400万新发病例。HCV感染率在 在该区序列相似 ，需要通过其他区域进行区分 [3】。 不同国家和地区有很大差异，我国HCV感染率也相 NS5b区变异较大，易于区分不同病毒株，常被选作 当高，抗 一HCV的阳性率平均为3．2％，略高于全球平 亚型区分依据。Simmonds等 选择NS5b作为分型 均水平。HCV基因分型有助于判断治疗难易程度 ，确 区，利用核酸测序及系统进化分析，最终确立为国际 定抗病毒疗程和个体化治疗方案，本文就HCV基因 通用的HCV分型命名，即将 HCV分为 6种主要基 分型的意义、常用方法和l临床应用情况作简要述评。 因型及一系列亚型。对两个 以上的区域如 5UTR与 C区、E1与NS5b区或E1与C区直接进行测序和 1 HCV分子生物学特征及基因分型基础 系统进化分析，则可使分型范围更广，是HCV分型 HCV是一种单股正链RNA病毒，由于基因型 的 金“标准” J。 不同，从各地分离的HCV基因组长度也不一致， 目前根据全世界不同地区分离的HCV不同株的 一 般为9400左右个核苷酸。基因组5’和 3’端分别 全部或部分基因组的系统进化分析，HCV呈现三个 为非编码区 (untranslatedregeion，UTR)，中央部分 水平的遗传变异性：型 (types)、亚型 (subtypes) 为一个大的开放阅读码框架 (openreadingframe， 和准病毒株 (quasispecies)。HCV至少可分为6个 ORF)。结构区又分为核心蛋 白基因区 (C区)和衣 基因型 (HCVI~6型 )，包含超过 100个基 因亚型 壳蛋 白基因区 (E1和 E2)；非结构区又分为