科学工作流管理平台TotemSWF的设计与实现.pdfVIP

第2卷 第10期 2007 年 10 月 中国科技论文在线 SCIENCEPAPER ONLINE 741 科学工作流管理平台 TotemSWF 的设计与实现 黄泽谦 1 ，王黎维 2 ，彭智勇 1,3 （1. 武汉大学软件工程国家重点实验室, 武汉 430072; 2. 武汉大学国际软件学院, 武汉 430072; 3. 武汉大学计算机学院, 武汉 430072 ） 摘 要：本文提出以数据库管理系统(DBMS)为中心的科学工作流管理架构，基于对象代理数据库 Totem ，实现了 科学工作流管理平台TotemSWF 。该平台采用对象代理模型对工作流建模，工作流被定义为数据库模式及数据库规 则与触发器。在Totem 中，通过数据管理操作实现工作流管理，对象间的双向指针实现高效数据跟踪。 关键词：计算机软件；TotemSWF ；对象代理数据库；科学工作流 中图分类号：TP31 文献标识码：A 文章编号：1673－7180(2007)10 －0741 －7 0 引言 1 TotemSWF 科学工作流管理平台框架 科学工作流(Scientific Workflow)是工作流技术在 TotemSWF 科学工作流管理平台包含以下基本功 科学研究领域的应用，如今已成为在网络基础设施之 能模块：工作流声明，工作流执行和数据跟踪等。我 上进行大规模科学计算和协同研究的有效方法。相对 们以 DBMS 为核心，在对象代理数据库 Totem 基础上 于以过程为中心、面向控制流的商业工作流，科学工 实现科学工作流管理，各个功能模块采用数据库技术 作流通常是以数据为中心、面向数据流的分析管道。 实现，平台框架如图 1 所示。 一般的工作流管理系统(WFMS)使用数据库管理系统 (DBMS)来存储任务描述以及工作流数据，并在 DBMS 之上实现各个工作流功能模块。然而目前一些研究证 明，大多数 WFMS 的功能可以由 DBMS 来提供，许 多成熟的数据库技术可以用于工作流管理系统中[1] 。针 对科学工作流以数据为中心的主要特点，采取 DBMS 的方式来实现科学工作流管理，可以减少实现开销， 增加优化的可能性，并以一种类似于传统数据管理操 作的方式进行工作流管理。 本文拟解决的问题是基于对象代理数据库管理系 统实现科学工作流管理。其特点为：(1) 以对象代理模 型来建模科学工作流中的数据流；(2) 通过定义数据库 规则和触发器实现工作流自动执行；(3) 采用类 SQL 图 1 TotemSWF 科学工作流管理平台框架 语言进行工作流管理；(4) 基于对象代理数据库实现数 Fig. 1 The architecture of TotemSWF 据跟踪。 基金项目： 国家自然科学基金项目），教育部新世纪优秀人才计划项目(NCET-04-0675) ，教育部博士点基金项目 (20050486024) ，教育部科学技术研究重点项目（107072） 作者简介：黄泽谦（1983— ），男，博士研究生 通讯联系人：彭智勇，教授，E-mail ：peng@whu.edu.cn 第2卷 第10期 742 科学工作流管理平台 TotemSWF 的设计与实现 2007年10月 1.1 对象代理数据库 Totem 作流[4] 。工作流的流程如图 2 所示，该工作流包括