原创力文档- 1、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
- 2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
- 4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
- 5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
- 6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
- 7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次， 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
浙江农业学报ActaAgriculturaeZhejiangensis，2012，24(6)：961-968 http：／／www．zjnyxb．cn
宋雪梅，姜俊芳，蒋永清．MutationSurveyor在插~k／缺失杂合子突变分析中的应用[J]．浙江农业学报，2012，24(6)：961
— 968．
MutationSurveyor在插入／缺失杂合子突变分析中的应用
宋雪梅，姜俊芳，蒋永清
(浙江省农业科学院 畜牧兽医研究所，浙江 杭州 310021)
摘 要：结合实例简述了MutationSurveyor软件在碱基替换和插入／缺失突变，尤其是插入／缺失杂合子突变
研究中的应用。以浙江省余杭湖羊场和屠宰场 144头湖羊为试验材料，采用 PCR—SSCP和测序的方法检测干
扰素刺激基因(ISG15)基因5侧翼区序列，并利用MutationSurveyor软件分析其遗传多态性。PCR—SSCP检测
结果显示ISG15基因5侧翼区PCR-SSCP带型非常复杂 ，无法直接判定个体的基因型。利用MutationSurvey—
or软件分析发现湖羊ISG15基因5侧翼区存在 152C／T，158dupC和239C／T3种突变。其中152C／TC等
位基因频率为0．83，为低度多态的分子标记；158dupC等位基因频率为0．5125，239C／TC等位基因频率为
0．7675，均为中度多态的分子标记。除239C／T外，152C／T和 158dupC均处于 Hardy—Weinberg平衡状态 (P
0．05)。试验结果显示MutationSurveyor软件在分析插入／缺失杂合子突变的测序结果时有较大优势，可用
于碱基替换和插入／缺失SNPs的通量筛选和分析。
关键词：MutationSurveyor；InDel；ISG15；湖羊
中图分类号：S823．2 文献标志码：A 文章编号：1004—1524(2012)06-0961—08
Application ofM utation SurveyorinanalyzingheterozygousInDel
SONGXue—mei，JIANGJun·fang，JIANGYong-qing
(InstituteofAnimalHusbandryandVeterinary，ZhefiangAcademyofAgricuhralScicences，Hangzhou30021，China)
Abstract：ThepresentstudyaimedtoshowtheapplicationofMutationSurveyorinanalyzingnucleotidesubstitutions
andInDelwithna instance．ThepolymorphismsinISG155 flankingsequenceswereanalyzedfor144Husheepfrom
YuhangHusheepfarm and slaughterhouse bypolymerasechainreaction—singlestrandconformationpolymorphism
(PCR—SSCP)technique，DNAsequencingandMutationSurveyorsoftware．PCR—SSCPanalysisshowed1SG155
flankingsequencesbandsweretoocomplextodeterminegenotypedirectly．TheanalysisresultofMutationSurveyor
foundtherewerethreepolymorphisms，152C／T，158dupC and239C／T，inISG155 flankingregion．Therfequen-
cyofalleleCinloci152was0．83showinglowpolymorphism (PIC =0．2424)．TherfequencyofalleledupCinlo—
ci158was0．5125showingmediatepolymorphism (PIC = 0．3748)．T
文档评论（0）