橡胶树炭疽病菌Cap2移基因的克隆和序列分析.pdfVIP

热带作物学报 2012，33(11)：1991—1995 ChineseJournalofTropicalCrops 橡胶树炭疽病菌Cap20基因的克隆和序列分析 林春花，李超萍，李博勋，周 维，黄贵修 中国热带农业科 学院环境与植物保护研 究所 农业部热带作物有害生物综合治理重点实验室 海南海 口 571101 海南省热带农业有害生物监测与控制重点实验室 摘 要 根据鳄梨胶孢炭疽菌 Cap20基 因序列设计引物 ．利用 同源基 因克隆法获得橡胶树胶孢炭疽菌和尖孢炭 疽菌 Cap20基 因，同时进行核苷酸序列、氨基酸序列及聚类分析 。结果表 明：2种橡胶树炭疽菌的Cap20基 因 ． 均含 2个外显子和 1个 内含子 ，编码 183个氨基酸 ：橡胶树胶孢炭疽菌与鳄梨胶孢炭疽菌同源性最高，其核苷 酸序列同源性达 90．3％，氨基酸序列同源性达 98．9％；来 自橡胶树的2种炭疽菌Cap20基因序列存在较大差异。 其核苷酸水平同源性仅为 73．8％，氨基酸水平同源性为 79．8％：炭疽菌 CAP20和绿僵菌MPL1蛋 白结构具有 42％的同源性 ．所含蛋 白结构域相似 ．推测炭疽菌 Cap20基 因可能与绿僵菌 mpll基 因功能具有相似性 。 关键词 橡胶树 ；尖孢炭疽菌；胶孢炭疽菌；Cap20；基因克隆 中图分类号 $432．4+2 文献标识码 A Cloning and SequencesAnalysisofGeneCap20 From thePathogensColletotrichum spp． CausingLeafDiseaseofRubberTree LIN Chunhua。LIChaoping，LIBoxun，ZHOU Wei，HUANG Guixiu EnvironmentandHnatProtectionInstituteofChineseAcademyof TropicalAgricuhura!Sciences／KeyLaboratoryof IntegratedPestManagementonTropicalGrops．Ministry ofAgricultureIHainanKeyLbaoratoryforMonitoringand ControlofTropicalArgiculturalPests，Haikou,Hainna 571101，China Abstract In this study，the primerswere designed according to the Cap20 gene sequences in NCBIdatabase． DNA and eDNA sequencesofCap20 from the twopathogenscausing Leafdiseaseofrubbertreewereamplified by polymerase Chain Reaction and Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction，and then the amplification productswere sequenced and alignedwith theother 3Colletotrichum speciesCap20 gene sequences．Theresults showed thatthefullopen readingrfamesofCop20 geneof2 speciesfrom rubbertree contained2 exonsand 1 intron，and encoded a protein of 183 amino acids；Cap20 genesfrom the same species of e gloeosporioides of therubbertreeandavocado showed 90．3％ sim