长双歧杆菌PCR快速定向筛选方法.pdfVIP

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、)ln^,w.chinadairy.net 中国乳品工业 da/ryINDUSTRY zgrpgy@163.corn 长双歧杆菌PCR快速定向筛选方法 张红发 一.任婧 (1.光 明乳 业股份 有 限公 司 技 术 中心 ,上 海 200436;2.江南大 学 食 品学 院 ,江 苏 无锡 214122) 摘 要:传统筛种方法具有随机性、盲 目性, PCR筛菌,增加 了 目的性和效率。在基 因序列数据库 中查找益生双歧杆菌的16SrDNA 共有序列,找 出它们共有 的特异性序列,设计 了PCR~Jl物 。平板培养分离,初步筛选双歧杆菌菌落。根据细菌16SrDNA和23SrDNA两 侧 高度保守区域设计通用引物,提取茵落基 因组DNA,扩增16S一23SrDNA 间区序列 ,并送测序 。通过序列同源性 比对分析 ,鉴定 、筛选 到人体长双歧杆菌。 关键词:长双歧杆菌;PCR;定向筛选;菌种鉴定 中图分类号 :Q93—331 文献标识码 :A 文章编号 :1001—2230(2012)12—0026—02 RapidPCRmethodfordirectionalscreeningBifidobacteriumlongum ZHANGHong—fa1,2~,RENJing (1.TechnologyCenter,BrightD airy FoodCo.Ltd.,Shanghai200436,China; 2.FoodScienceandTechnoloyg SchoolofJiangnanUniversity,Wuxi214122,China) Abstract:ItincreasedthepurposeandefficiencyusingPCR toscreeningbacteria,whiletraditionalmethodshavethecharactersofrandomness andblindness.PrimersforPCR weredesignedbasedonnucleotidesequencesoftheCO1TnTlonandspecificregionof16SrDNA ofrtheprobi- oticBifidobacterium strains.Afterculturingon theagarplate,thecolonieswereprimarily screenedwiht PCR 。A pairofuniversalprimerswere designed according to the highly conserved regionsof16S rDNA and 23SrDNA.Afterextraction ofgenomicDNA from the screened colonies,thePCR productsof16S一23SrDNA intergenicspacerweresequenced.Theisolatedcolonieswereidentified accordingtOsequence analysisusingBlastintheGenbank.Atlast,thestrainsofBfiidobacteriumlongumhavebeensuccessfullyscreenedout. Keywords:Bfiidobacteriumlongum;PCR;directionalscreening;strainidentification rRNA 基 因大 10倍 ,可用 于菌 种鉴 定 。 0 引 言 设计 一 系列PcR引物 ,定 向筛选 长 双歧 杆菌 ,建 人 体 内 固有 的双歧 杆 菌是 长 期 自然选 择 的结 果 , 立 快速PCR筛 菌技术 平 台 。 而 目前在 市场 上 应用 的双 歧杆

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