2010年南京人群甲型H3N2流感分离毒株全基因组特性分析.pdf.pdfVIP

中国人兽共 患病学报 2012，28 (5) ChineseJournalofZoonoses 433 文章编号 ：1002—2694(2012)05—0433—05 2010年南京人群甲型H3N2流感 分离毒株全基因组特性分析* 罗鹏飞 ，曹 尚 ，李 伟 ，李 亮。，吴 斌 ，秦 圆方。，邓 斐 ，崔仑标。，焦永军 ，祁 贤 ，卫平民 摘 要 ：目的 分析2010年南京地 区甲型 H3N2流感病毒的分子特征和演化趋势 。方法 测定 2010年期间所分离 3株 病毒的8个 RNA片段 的核苷酸序列。构建各个基 因基于核苷酸序列的系统发生树 ，并分析分离毒株与参考毒株 l1个基 因 特定氨基酸位点的变异情况。结果 在 3株病毒中，未发生片段间的重配。以A／Perth／16／2O09为参考，3个分离毒株发生 在 HA和 NA蛋 白抗原决定簇 的氨基酸变异均数分别为 5．7和 1．3；以A／Brisbane／1O／2oO7为参考 ，3株病毒 PB1的第 375 位发生突变(s—G)，Nanjing／1655和 Nanjing／1663的PB1一F2蛋 白第 26位缺失。另外3株病毒 M2的金刚烷胺耐药位点 (31位)为 N。结论 所测 3株流感病毒 HA基 因的氨基酸变异可能导致新流行株 的形成 ，病毒对金刚烷胺耐受而对神经氨 酸酶抑制剂敏感 。病毒 的PB1第 375位和 PB1一F2第 26位的变异可能成为 H3N2病毒新的进化方 向。 关键词：甲型流感病毒；H3N2亚型；进化；分子特征 中图分类号 ：R373 文献标识码 ：A Analysisongenom iccharacteristicsofH3N2subtype influenzaA virusisolatedinNanjing，2010 LUO Peng—fei，CAO Shang，LIW ei，LILiang，W U Bin，QIN Yuan—fang， DENG Fei，CUILun—biao，JIAO Yong—jun，QIXian，WEIPing—min (DepartmentofEpidemiologyandHealthStatistics，CollegeofPublicHealth， SoutheastUniversity，Nanjing210009，China) ABSTRACT：ThemolecularcharacteristicsandevolutionaryfeaturesofH3N2subtypeinfluenzaA virusesin2010weretO bedetermined．EightRNA segmentsof3virusweresequenced．Thephylogenetictreeswereconstructedforanalysisofevolu— tionarycharacteristics．andvariationsofimportantaminoacidsitesofal1elevenkindsofproteinwereanalyzed．Noreassort— mentwasobservedinourisolates．ComparedwithisolateA／Perth／16／2OO9，averagevariationsnumberofaminoacidsiteof HA andNA proteinantigenicdeterminantswere5．7and1．3respectively．ComparedwithisolateA／brisheme10／2997，thea— mino-acidposition375ofPB1proteininallisolateshadvaried(S—，G)andposition25ofPB1一F2proteininbothNanjing／1655 andNanjing／1663weredeleted．Inaddition，position31ofM2proteininallthreeisolates