苜蓿HD-Zip转录因子基因Mfhb-1的生物信息学分析.pdfVIP

124 广东农业科学 2011年第 l6期 苜蓿HD—Zip转录因子基因Mfhb一1的生物信息学分析 周 岩 ，魏琦超 ，何 男男 (河南科技学院生命科技学院，河南 新乡 453003) 摘 要 ：采用生物信息学方法对苜蓿坳 6—1基因的功能、一般理化性质、疏水性、二级结构和亚细胞定位进行分析 ，并进行同 源建模。结果表明，该基因包含一个 861bp的ORF，编码长度为 286个氨基酸残基的HD—Zip转录因子。该转录因子为一个亲水性 的蛋白，具有Or．一螺旋、无规则卷曲等二级结构元件 ，定位于细胞核中。 关键词 ：苜蓿；HD—Zip转 录因子 ；MJhb一1基因；生物信息学分析 中图分类号 ：$551．9；Q754 文献标识码 ：A 文章编号：1004—874X(2011)16—0124—03 BioinformaticsanalysisofHD-Ziptranscriptionfactor geneMfhb-1fromAlfalfa(MedicagoFalcataL．) ZHOUYan，WEIQi—chao，HENan—nan (SchooleofLifeScienceandTechnology,Henna InstituteofScierweandTechnology,Xinxiang453003，China) Abstract：SomecharactersoftheMfl~b—lfromalfalfaanditsencodedproteinsequencewerepredictedandanalyzedbythemethods ofbioilfformatiesin thefollowingaspects，includingthefunction，generalphysicalandchemicalproperties，hydrophobicity，secondary structureandlocalization sitesin cells．Andtheaminoacid sequencewasusedtomodelbasedon homology．Resultsshowedthatthe Mfhb一1containedacompleteORF(861bp)whichencoded286aminoacid．ThepeptidewasaHD-Ziptranscriptionfactor，whichlocated innucleus．Themainsecondarystructureelementsofthepeptidewerealphahelixandrandonlcoil． Keywords：alfalfa；HD-Ziptranscriptionfactor；MJhb-1gene；bioinformaticsanalysis 同源异 型域一亮 氨酸拉 链 (Homeodomain—Leucine 核苷酸序列翻译成氨基酸序列，并将该氨基酸序列应用 zipper，HD—Zip)蛋 白属于 同源异型盒蛋 白家族 中为植物 BLASTP程序 2[-31搜索 Genbank的Non—redundantprotein 所特有的一类转录因子。HD—Zip蛋 白在植物发育过程 中 sequences(Nr)数据库 ，根据搜索到的同源蛋白序列的注释 的作用非常广泛 。如维管发育、器官形成 、分生组织的维 信息判定该插入序列编码产物的功能。 持、逆境应答等ll1。20世纪90年代中期，英国DeMontfort 1．3 重组质粒 pMf-1475插入序列开放阅读框编码蛋 白 大学的NormanBorlaug植物研究所利用扣除克隆技术 ， 质的生物信息学分析 首次从处于体细胞胚胎发生阶段的苜蓿 (Medicagofalcata