GSAS:针对基因序列的集成分析系统.pdfVIP

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第 卷 第 期 华 中 农 业 大 学 学 报 32 4 Vol.32 No.4 年 月 , 2013 7 JournalofHuazhon A riculturalUniversit Jul2013143~148 g g y y : GSAS 针对基因序列的集成分析系统 黄 钰 李 平 李儒苗 魏小梅 胡 滨 王建勇 , 华中农业大学理学院 武汉 430070 摘要 以 环境为基础构建 个基于工作流的基因序列分析系统 ( J2EE 1 GSAS eneseuenceanalsisss g q y y- ), 、 , , tem 该系统提供统一的数据 算法接口和可视化的图形界面 集成多种关键的序列分析算法和工具 同时实现 异构数据的整合。GSAS所采用的工作流机制为基因序列分析领域提供了协作研究的解决方案。 ; ; ; ; 关键词 基因序列 序列分析 接口 集成 软件系统 中图分类号 文献标识码 文章编号 ( ) TP311.52 A 1000-2421201304-0143-06 , , ) , 目前 人类的基因序列图谱已经全部构建完成 因本体 条款 为 21603个表现最好的小鼠基因提 , 基因组的研究也从先前的结构基因组学转向功能基 交了 组预测 并且确定了当前的功能基因组数据 1 [] 1 。 , , 因组学 如何确定基因的功能 以及弄清全部的 集的优缺点以及与相关功能预测算法的性能比较 遗传信息成为当今生命科学最重要的研究领域之 。 该工具集成了一系列统计学预测和注释算法 然 。 , , 一 有关生命科学的基因序列分析研究中 随着计 而 上述软件工具都没有提供一致的算法和数据接 , , , 算机技术和相关实验技术的不断发展 不同实验室 口 而且实现的算法和功能比较单一 使得研究人员 , 产生了大量异构的生物学基因序列数据 针对这些 需要使用多个软件包去分析这些

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