3株新城疫山东分离株HN基因全序列测定和分析.pdfVIP

维普资讯 · 20 · AnimalHusbandry＆Veterinary Medicine 2008 Vo1．40 No．2 3株新城疫山东分离株 HN基因 全序列测定和分析 刘 栋 ，莫贞峰 ，赫 静 ， 王 娟 ，朱剑英 ，牛钟相 (1．山东农业大学动物科技学院，山东 泰安 271018 2．山东省济南市畜牧办公室，山东 济南 250002) 摘要：用设计的特异性引物，通过RTPCR法对1999和2004年间分离 自山东省的具有一定代表性的3株鸡新城疫病毒 (ShD．2-04，ShD．3-99， ShD-5-04)进行HN基因的扩增和克隆，并对其进行核苷酸序列测定和分析。结果表明：3个毒株HN基因开放性阅读框架 (ORF)均为 1716 bp，编码571个氯基酸，属强毒的c群 ；3株 山东分离毒的核苷酸同源性为98．2％～98．8％，氨基酸同源性为98．4％～98．8％，其中SHD-2-04和 ShD-5-04核苷酸及氨基酸同源性均为最高，达到99．8％和99．8％；将 3株山东分离毒株与国内外标准强毒株及弱毒株的HN基因核苷酸及氨基酸 同源性分别进行比较：3毒株与国内外标准毒株HN的核苷酸同源性为 82．7％～87．2％，氨基酸同源性为 87．6％～90．0％，表明已发生一定的 变异。 关键词：新城疫病毒；HN基因；序列分析 中图分类号：$83l 文献标识码：A 文章编号：0529-5130(2008)02—0020—04 Cloningand sequenceanalysisofHN genesofthreestrainsof Newcastlediseasevirusisolatedfrom Shandongprovince LIU Dong ，MO Zhen—feng。 HEJing。， ， WANGJuan。 ZHUJian—ying，NIU Zhong—xiang ， (1．CollegeofAnimalScienceVeterinaryMedicine，ShandongAgricultureUniversity，Taian271018，China； 2．OfficeofJinanAnimalHusbandry，Jinan250002，China) Abstract：Withapairofspecificprimers，thefragmentcontaininghemagglutinnin—neuriminidase(HN)genesofthreerepresentative strainsofNewcastlediseasevirus(NDV)，ShD一2-04，ShD一3-99andShD一5-04，isolatedfromShandongbetween1999and2004wereampli— fledbyreversetranscription—polymerasechainreaction(RT—PCR)．TheHNgenesweresequencedafterPCRproductswerecloned．There— suitsshowedthatallthethreeShandongisolateshadopeningreadingfragment(ORF)withthelengthofl716bp，encoding571aminoacids andbelongedtoCviurlentgroup．Thehomol