低温对罗非鱼基因组DNA甲基化的影响.pdfVIP

第 卷第 期 水 产 学 报 年 月 文章编号 低温对罗非鱼基因组 甲基化的影响 朱华平 卢迈新 黄樟翰 高风英 可小丽 刘志刚 李庆勇 刘玉姣 中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部热带亚热带水产资源利用与养殖重点实验室广东 广州 上海海洋大学水产与生命学院上海 摘要 以经过连续多代抗寒选育获得的尼罗罗非鱼耐寒品系为实验材料采用 甲基化敏 感扩增多态性 分析方法从全基因组水平 上探讨了低温适应对罗非鱼 序列中 位点的甲基化水平的影响 结果显示选用 的 对选择性扩增引物共检测到 个位点 耐寒品系检测到的位点数为 个对照组为 个其中发生甲基化的位点数分别为 和 个总甲基化率分别为 和 全甲基化位点分别为 个和 个全甲基化率分别为 和 半甲基化位点分别 为 个和 个半甲基化率分别为 和 结果分析表明尼罗罗非鱼耐寒品系 的总甲基化水平全甲基化水平和半甲基化水平较对照组均有一定程度的下降 与对照组相 比尼罗罗非鱼耐寒品系基因组 甲基化总体水平下降了 其中以全甲基化位点变 异为主其下降幅度比例明显为 由此可见经过连续多代的低温胁迫可导致尼罗罗 非鱼 甲基化水平发生改变发生了去甲基化反应表现为基因组甲基化程度降低的特 征说明了 甲基化与罗非鱼抗寒性反应密切相关 关键词 尼罗罗非鱼 低温 甲基化 甲基化敏感扩增多态性 中图分类号 文献标志码 甲基化作为细胞内普遍发生的一种修 甲基化多态性而且许多受甲基化变化诱导的基 饰过程和反应是基因组 的一种主要表观 因同胁迫反应有关说明了 甲基化参与环 遗传修饰形式 也是调节基因功能的重要手 境胁迫下基因的表达调控过程 甲基化 段 甲基化的生物学作用主要体现在维 作为近年来表观遗传学研究领域最为关注的热点 持基因组的稳定性和基因表达调控 个大方面 之一 将为农业带来重大影响为选择适应特 甲基化的状态与机体内的生命现象密切相 定环境的生物等育种工作提供帮助 关如基因组和染色体结构的稳定 染色体 罗非鱼作为世界性的重要养殖鱼类之一在 失活 基因组印迹 基因的转录调节和转座 国际淡水鱼贸易中已跃居第 位仅次于鲑鱼和 子元件的活性和基因沉默 等 甲基化状 鳟鱼 但罗非鱼属热