传染性造血器官坏死病毒-Sn株基质蛋白基因克隆及生物信息学分析.pdfVIP

第 卷第 期 水 产 学 报 年 月 文章编号 传染性造血器官坏死病毒株基质蛋白 基因克隆及生物信息学分析 徐黎明 刘洪柏 卢彤岩 中国水产科学研究院黑龙江水产研究所黑龙江 哈尔滨 摘要 基质蛋白 是传染性造血器官坏死病毒 主要结构蛋白之一是病毒感染后造成细胞凋亡的主要作用蛋白 为分 析 蛋白的序列及结构特征研究利用敏感细胞培养传染性造血器官坏死病毒 分离株 根据 蛋白基因开放阅读框 的序列设计引 物利用 的方法克隆得到 蛋白全长 并且构建至表达载体 中构 建出 重组质粒 生物信息学分析结果显示 蛋白基因的序列长度为 编码 个氨基酸残基推导分子量约为 等电点为 氨基酸序列分析表明 蛋白富 含丝氨酸苏氨酸以及碱性氨基酸存在丰富的 螺旋 折叠和无规则卷曲 蛋白不含有 信号肽疏水性大于亲水性没有跨膜区存在抗原表位预测显示抗原性良好结构预测显示 不存在糖基化位点存在 个潜在的糖基化位点和 个潜在的磷酸化位点 系统进化 树分析显示 株与美国分离株同为一簇 关键词 传染性造血器官坏死病毒 株 基质蛋白 生物信息学分析 中图分类号 文献标志码 传 染 性 造 血 器 官 坏 死 病 类弹状病毒的 蛋白具有多种重要的功能作用 是极其严重的鱼类急 主要是通过病毒的螺旋状核衣壳及插入宿主胞膜 性全身性传染病世界动物卫生组织将其列 内的蛋白胞浆结构域相互作用以启动病毒粒 为必须申报的动物疫病为我国的二类疫病 子的装配出芽 研究表明 的 蛋白能 据不完全统计 的爆发造成的虹鳟大鱼死亡率 抑制宿主细胞的基因转录并能诱导细胞程序性 为 鱼苗死亡率可达 目前我 死亡 利用 蛋白的细胞凋亡作用 国没有有效的防控药物 已成为制约我国冷水 等 设计了 自杀性核酸疫苗在获得免疫保 鱼养殖健康和可持续发展的瓶颈问题 属 护之后诱导含有核酸疫苗的细胞程序性死亡以 弹状病毒科 诺拉弹状病毒属 期通过该方法解决核酸疫苗残留带来的潜在的安 病毒粒子含有一条线 全性问题目前该项研究取得了一定的进展 状反义单链的全基因组长度约为 目前国内尚无有效防控 的药物因此对 从 端至 端依次包含 病毒本身特性的了解对疾病防控药物的研 个基因分别编码病毒核蛋白磷蛋白基质蛋白 究具有重要的指导意义