采取分子生物学技术分析不同施肥土壤中细菌多样性.pdfVIP

中国农业科学 2005, 38(12):2474-2480 Scientia Agricultura Sinica 采用分子生物学技术分析不同施肥土壤中细菌多样性 吴展才，余旭胜，徐源泰 （台湾大学园艺学研究所，台北 10600 ） 摘要：本研究探讨在小白菜栽培时，分别添加果蔬加工废弃物生产的堆肥和化肥对土壤微生物区系的影响。 利用扩增16S rRNA基因来比较微生物群落的技术，分离出所有群落DNA，再以此DNA为模板，以专一性引物扩增 出 16S rRNA 基因（rDNA）。随后建立 16S rDNA 基因文库后，再以计算机仿真的方式，选出能将上述引物扩增的 16S rDNA 基因中间切割成片段长度范围集中的一组限制性内切酶——AciI、BstUI、和 RsaI。结果表明，无施肥 土壤与添加堆肥土壤中微生物较接近。无施肥、添加堆肥、添加化肥土壤三者的微生物多样性指数分别为0.990、 0.986和0.962；均匀度为0.979、0.977和0.931。 关键词：堆肥；化肥；土壤微生物；多样性；均匀度 Analysis on Microbial Diversity of Different Agricultural Soils by Using Molecular Biology Technique NG Chang-chai ，YU Hsu-sheng ，SHYU Yuan-tay (Institute of Horticulture, Taiwan University, Taibei 10600) Abstract: The microbial diversity and evenness in three different soil samples: compost-treated, chemical fertilizer-treated and control group soil samples were studied. The 16S rRNA gene cloning and restriction fragment length polymorphism (RFLP) were used for the comparison of soil microbe community. The optimization of RFLP digestion was firstly carried out, and AciI, BstUI, RsaI were optimal restriction enzymes for the digestion. The diversity indexes of soil microbes were also calculated and the indices of three treatments: control, compost, and chemical fertilizer-treated soils, are 0.990, 0.986, and 0.962 for D value, respectively; and 0.979, 0.977, and 0.931 for evenness, respectively. Key words: Compost; Chemical fertilizer; Soil microorganism; Diversity; Evenness 以土壤微生物分解植物、动物残体产生有助于土 近年来，为改善土壤环境中农药及工业、民用废弃物 壤保水力，以及改良土壤物理状况、减缓冲蚀和流失 的污染，以及维护生态平衡，使得具有特殊分解能力 的腐殖质[1, 2]，堆肥是这一过程的最好体现，腐熟后的 的土壤微生物益显其重要性。对土壤微生物菌落结构 物质可以储存或施用于农田，对环境无负面影响。经 的了解，是农业生态环