凡纳滨对虾内脏几丁质酶基因的克隆、序列分析与结构预测.pdfVIP

凡纳滨对虾内脏几丁质酶基因的克隆、序列分析与结构预测.pdf

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28 3 Vol. 28, No. 3 2009 8 JOURNAL OF OCEANOGRAPHY IN TAIWAN STRAIT Aug. , 2009 1 2 3 1 1 1 黄乾生, 陈超琪 , 谢晓兰, 王 烨 , 石 艳, 陈清西 ( 1. , 361005; 2. , 100082; 3. , 362000) : 几丁质酶是甲壳动物顺利完成生理性蜕壳的关键功能酶. 已有研究表明几丁质酶是一个多 因家族.根据甲壳动物几丁质酶保守序列设计引物, 应用反转录 PCR 方法从凡纳滨对虾 (L itopenaeus vannamei) 内脏中扩增得到部分几丁质酶编码 因片段, 进一步结合 RACE法, 克隆得 到该几丁质酶完整编码序列. 生物信息学分析表明其含有信号肽序列几丁质酶催化中心序列 PEST连接区和几丁质底物结合部位序列. 序列比对发现其与中国对虾( ABB85237. 1)斑节对虾 (AF157503. 1)和日本对虾几丁质酶( BAA 12287. 1)具有很高的相似度. : 生物信息学; 凡纳滨对虾; 几丁质酶; 因克隆; 序列比对 : Q 356. 1 : A : 2009) ( EC 3. 2. 1. 1 ). , [ 1] . . , 18 [ 2] . . , . [ 3] , , , , . , . (L itopenaeus vannam ei) , , , , . , . , ( nucleotide accession number: AF315689). , , . 1 1. 1 RNA Trizol Invitrogen . Taq Fermentas. MMLV PMD18TTakara. M arker. OMEGA . . DH5. . 1. 2 1. 2. 1 因克隆 Trizol RNA, MM LV cDNA. NCBI genebank 3, ( Fenneropenaeus chinensis)(Penaeusmonodon)(M arsup enaeus jap onicus). 3 , chi11f ch i11r( 1). PCR 20mm 3 3 3 3 3 2mm buffer2mmol/dm MgCl0. 5mol/dm 1mm cDNA 1U Taq0. 2mmol/dm 2 : 2008092 : ( 2006N0067); ( 20070 10806) : ( 1982~ ), , . : , , (); Em ail: chenqx@ xm u. edu. cn ! 356! 28 dNTP. : 95 3m in, 95 0s, 58~ 62 0s, 72 1m in 50s, 35 ; 72 7m in. PCR 1%. PCR, OMEGA PCR . DNA PMD18T , DH5, . , , PCR, ( ). RACE( cDNA ). : GSP1 GSP2 ( 1

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