南海沉积物微生物多样性及群落结构研究.pdf

摘要 摘要 基于非培养的16SrDNA分子技术是目前调查环境中微生物多样性的不可 替代的方法。从IMAGES147航次Marco航段在南海采集的沉积物中扩增了细 菌和古菌16S 共7个沉积物柱表层沉积物细菌和古菌16SrDNA文库，并对16SrDNA文库中 的序列进行了系统发育分析。 群落的多样性指数表明细菌和古菌多样性都比较丰富，对沉积物样品中的物 种丰度估计显示细菌平均丰度为50左右，古茵平均丰度为30左右。在99％、 98％、97％、95％、90％、80％的16S rDNA序列一致性取舍值下，利用参数分布 以3％、5％、10％和20％的序列差异作为细菌的“种’’、“属”、“科／“纲和 “门分类单元的界限，那么沉积物柱MD05．2896中的细菌估计有250个种， 220士6(SE)个“属”，127“(SE)个“科’’／“纲和624-4(SE)个“门；沉积物 个“科’’，“纲’’和42士2(SE)个“门’’。 系统发育分析结果表明，南海沉积物细菌16SrDNA文库中的多数序列隶属 candidate division rDNA文库中的序列 BRC．1等21个类群；少数序列隶属于未知类群。古菌16S 广古生菌包括MarineBenthic D(MBGD)、SouthAfricanGoldMine Group Miscellaneous Euryarcheaotic EuryarchaeoticGroup Group(SAGMEG)、Terrestrial (TMEG)、Novel EuryarchaeoticGroup(NEG)、MicellaenousEuryarchacotic Bethic Group(MEG)、MarineGroup BenthicB(MBGB)、 Methanosarcinales等8个类群；泉古生菌包括Marine Group Marine A(MBGA) CrenarchaeoficI(MGI)、C3、MarineBenthic Group Group 摘要 Crenarchaeotic 和Micellaenous Group(MCG)等5个类群。从类群相对百分含 量上看，在沉积物柱MD05．2896中，细菌群落以浮霉状菌、Delta．变形杆菌、 优势类群；在沉积物柱MD05．2902中，细菌群落以JSl、浮霉状菌和绿屈挠杆 I和MBGA 菌为优势类群，古菌群落以MBGD、SAGMEG、TMEG、MBGB、MG 为优势类群。 对比其他海域，南海沉积物中细菌和古菌群落的特点表现为浮霉状菌和 MBGD类群异常丰富而变形杆菌类群含量相对偏少。来自西沙海槽的沉积物柱 MD05．2902中的细菌群落与含甲烷水合物沉积物中的细菌群落中的优势类群一 致，为西沙海槽可能有甲烷水合物提供了又一佐证。在沉积物柱的垂向剖面上， 微生物群落类群百分含量变化总体表现为变形杆菌和MGI随沉积物深度的加深 而不断减少，其他类群百分含量变化则与沉积物深度无明显对应关系。 m、7m、8 m，lm、2m 分和聚类分析。在沉积物柱