从烟草上分离的中国番茄曲叶病毒及其卫星DNA全基因组结构特征.pdfVIP

基因组学 应用生物学，2011年，第 30卷，第 4朗，第 281—287页 GenomicsandAppliedBiology，2011，Vo1．30，No．4，281 研究报告 A Letter 从烟草上分离的中国番茄曲叶病毒及其卫星DNA全基因组结构特征 李波z 李战彪 韦茂春 卢燕回 廖咏梅 陈保善 蒙姣荣 1亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室，南宁，530004；2中国烟草总公司广西壮族 自治区公司，南宁，530022 通讯作者 mengiiaorong@163com 摘 要 本研究从具有典型曲叶病症状的广西靖西烟草病植株上分离到病毒分离物 Jx一2，全基因组序列测 定结果表明，JX一2DNA．A全长 2738个核苷酸，共编码 6个开放阅读框架(openreadingrfames，ORFs)，其中 病毒链编码AV1(CP)和 AV2两个 ORFs，互补链编码 AC1、AC2、AC3和 AC4共4个ORFs。BLAST结果表 明，J)(_2DNA—A与中国番茄曲叶病毒(Tomat0le curfChin0virus，ToLCCNV)各分离物 的相似性在 93．0％～ 99．7％之间，其 中与ToLCCNV广西番茄分离物ToLCCNV．G32的相似性最高，达 99．7％，而与其它双生病毒 的同源性均在88．0％以下，表明Jx一2是ToLCCNV的一个分离物。基于Jx一2和已报道的双生病毒属代表种 DNA．A全基因组核苷酸序列构建的系统进化树显示，JX一2与ToLCCNV．G32分离物的亲缘关系最近 ，并与 T0LCCNV其它分离物形成一个分支，而与其它 10种双生病毒的亲缘关系均相对较远 。利用双生病毒卫星 DNA~[的特异性引物 1301／1302在Jx 2样品中扩增到DNA3[分子(Jx一2p)，全长为 1341个核苷酸，其互补链 编码 1个 ORF(即 [3C1)，并包含一个富含 A序列和一个卫星病毒保守序列 。序列分析表 明，Jx一2p与 ToLCCNV伴随的DNA3[的相似性在 91．0％～96．1％之间，其中与ToLCCNV—G61DNAI3和 ToLCCNV—G18 DNA3[的相似性最高f96．1％)，与其它卫星DNAI3的相似性均低于 61．8％。基于Jx一2p全基因组核苷酸序列 构建的系统进化关系树显示，Jx～2B与ToLCCNVG61分离物伴随的DNA[~亲缘关系最近，并形成一个独 立的分支，再与ToLCCNV其余两个分离物伴随的DNA3[形成一个较大的分支。这是首次报道从烟草中分 离到的中国番茄曲叶病毒及其伴随卫星DNA分子的全基因组结构特征。 关键词 中国番茄曲叶病毒，烟草，双生病毒，DNA．A，卫星DNA GenomicCharacterizationofDNA．A andAssociatedSatelliteDNA Mole— culeofanIsolateofTomato2eafcurlChinavirusInfectingTobacco _ LiBo LiZhanbiao WeiMaochun LuYanhui LiaOYongmei ChenBaoshan M engJiaorong 1StateKeyLaboratoryforConservationandUtilizationofSubtropicalAgro—bioresources，Nanning，530004；2ChinaTobaccoMonopolyBureauof GuangxiZhuangAutonomousRegionBranchofCNTC，Nanning，530022 Correspondingauthor,mengjiaorong@163．com DOI：1O．3969／gab．030．000281 Abstract VirusisolateJX一2wasisolatedfrom tobaccoshowingtypicalleaf-curledsymptomsinJingxicountyof GuangxiProvince．ThecompletenucleotidesequenceOfJX 2DNA．A wasdeterminedtobe2 738nucleotides whichencoded6openreadingrfames(ORFs、includingtwotemplatestrand—encodingO