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课题2 多聚酶链式反应扩增DNA片段
教材内容解读
要点1 多聚酶链式反应
多聚酶链式反应是一种体外迅速扩增DNA片段的技术,它能以极少量的DNA为模 板,在几小时内复制出上百万份的DNA拷贝。
要点2 PCR原理
(1)在用PCR技术扩增DNA时,DNA的复制过程与细胞内DNA的复制类似.细胞内参与DNA复制的各种成分和基本条件以及各自的作用如下表:
参与的组分 在DNA复制中的作用 解旋酶 打开DNA双链 DNA母链 提供DNA复制的模板 4种脱氧核苷酸 合成子链的原料 DNA聚合酶 催化合成DNA子链 引物 使DNA聚合酶能够从引物的3’端开始连接脱氧核苷酸 (2)DNA的方向
通常将DNA的羟基(-OH)末端称为3’端,面磷酸基团的末端称为5’端。
(3)引物
引物是一小段DNA或RNA,它能与DNA母链的一段碱基序列互补配对。用于PCR的引物长度通常为20~30个核苷酸。
引物的作用:DNA聚合酶不能从头开始合成DNA,而只能从引物的3端延伸DNA链,因此,DNA复制需要引物。
(4)DNA的合成方向
当引物与DNA母链通过碱基互补配对结合后,DNA聚合酶就能从引物的3’端开始延伸DNA链,DNA的合成方向总是从子链的5’端向3’端延伸。
(5)DNA的变性与复性
在80-100℃的温度范围内,DNA的双螺旋结构将解体,双链分开,这个过程称为变性。当温度缓慢降低后,两条彼此分离的DNA链又会重新结合成双链,这个过程称为复性。
(6)PCR对DNA双链的解聚与结合控制
PCR利用了DNA的热变性原理,通过控制温度来控制双链的解聚与结合。
(7)TaqDNA聚合酶的应用
PCR中的高温会导致普通DNA聚合酶失活,而耐高温的TaqDNA聚合酶解决了这个问题,大大增加了PCR的效率,使PCR技术趋向自动化。
(8)PCR扩增DNA的基本条件
PCR反应需要在一定的缓冲溶液中提供:DNA模板,分别与两条模板链相结合的两种引物。四种脱氧核苷酸,耐热的DNA聚合酶,同时通过控制温度使DNA复制在体外反复进行。
要点3 PCR的反应过程
PCR一般要经历三十多次循环,每次循环可以分为变性、复性和延伸三步。从第二轮循环开始,上一次循环的产物也作为模板参与反应,并且由引物Ⅰ延伸而成的DNA单链会与引物Ⅱ结合,进行DNA的延伸。这样,DNA聚合酶只能特异地复制处于两个引物之间的DNA序列,使这段固定长度的序列呈指数扩增。
要点4 实验操作
做PCR通常使用微量离心管,它是一种薄壁塑料管,总容积为0.5mL。具体操作时,用微量移液器向微量离心管中依次加入各组分,再设计好PCR仪的循环程序就可以了。
如果没有PCR仪,可以设置3个恒温水浴锅,温度分别为94℃、55℃和72℃,然后按照上表的要求,在3个水浴锅中来回转移PCR反应的微量离心管即可。
PCR的突出优点是快速、高效、灵活和易于操作。
要点5 DNA含量的测定
DNA在260nm的紫外线波段有一强烈的吸收峰(见下图)。可以利用DNA的这一特点进行DNA含量的测定。具体步骤如下:
(1)将样品进行50倍稀释:取2LPCR反应液,加入98L蒸馏水。
(2)以蒸馏水作为空白对照,在波长260nm处,将紫外分光光度计的读数调节至零。
(3)加入步骤1中的DNA稀释液100L至比色杯中,测定260nm处的光吸收值。
(4)计算DNA含量。公式:DNA含量(g)=50×(260nm的读数)×稀释倍数。
要点6 实验注意事项
(1)为避免外源DNA等因素的污染,PCR实验中使用的微量离心管、枪头、缓冲液以及 蒸馏水等在使用前必须进行高压蒸气灭菌。
(2)在微量离心管中添加反应成分时,每吸取一种试剂后,移液器上的枪头都必须更换。所有的成分都加入后,盖严离心管口的盖子,用手指轻轻弹击管的侧壁,使反应液混合均匀,再将微量离心臂放在离心机上,离心约10s,使反应液集中在离心管底部,再放入PCR仪中 进行反应。
【文献资料】
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