单卵双胞胎银屑病患者外周血T细胞存在差异表达基因.pdfVIP

· 4 · ChinJDermatoVenerolIntegTradW Med2012，Vo1．11No．1 · 论 著 · 单卵双胞胎银屑病患者外周血T细胞存在差异 表达基因 刘淑梅 ，李俊琴 ，张开明 ，董峰 (1．山西医科大学第二医院 ，太原030001；2．太原市中心医院，太原030009；3．山西省长治市第二人 民医院，长治046000) 摘要：目的 通过对单卵双胞胎外周血T细胞的研究，寻找与银屑病发病相关的差异表达基因，进一步探讨T 细胞在银屑病发病中的机制。方法 采集两对同卵双胞胎 卜一对双胞胎同时患病 (P1、P2)，另一对双胞胎一个患病一个 不患病 (P3、N1)1外周血，分离并扩增T细胞 ，采用高通量RNA测序技术筛选差异表达基因，并对筛选的基 因进行 GO功能分析。结果 经过分析，共注释到9449个基因，其中P1与P2相比较在表达上无差异的基因有5438个，P3 与N1相比较在表达上存在差异的基因有2432个；差异表达基因在同时患病双胞胎 中占全部表达基因的57．55％， 在不同时患病双胞胎中占全部表达基因的25．74％，表明不同时患病双胞胎基因表达差异率明显高于同时患病组；银 屑病组与对照组相比较在表达上存在差异的基因有 105个；且与特应性皮炎组比较在表达上存在差异的基因有40 个，表达上调的基因有24个。结论 在外周血T细胞中，银屑病患者存在差异表达基因，可能与银屑病患者外周血T 细胞活性异常有关。 关键词：银屑病；外周血；T细胞；差异表达基因 中图分类号：R285 文献标识码：A 文章编号：1672—0709(2012)01—0004—04 ScreeningofDifferentialExpressedGenesinPeripheralTCellsofM onozygoticTwinsPatientswithPsoriasis LIUShu-mei，LIJun—qin2,ZHANGKai-ming2,DONGFend i．TheSecondHospitalofShanxiMedicalUnersity,Taiyuan030001，China；2．TaiyuanC￡yCentreHospital,Taiyuan 030009,China；3．SecondPeople HospitalofChangzhiCityinShanxiProvince．Changzhi046000,China Abstract：Objective TosearchdifferentialexpressedgenesinperipheralTcellsofmonozygotictwinspatientswith psoriasis，andtofurtherdiscusstheroleofTcellsinpathogenesisofpsoriasis．MethodsDifferentialexpressedgenesin peripheralTcellsoftwinspatientswithpsoriasisweresearchedthroughthenewgenerationtechnologyofhigh-throughput RNA sequencing，and also donewiththe GO functionalanalysis．Results9449 geneswereannotated afteranalysis， including5438geneswhichhadnodifferencecomparedwithP1andP2ingeneexpression，and2432geneshaddifferences comparedwithP3andN1ingeneexpression．Differentialexpressedgenesinbothdiseasedtwinsaccountedfor57．55％ ofall expressedgenes，and inonlyonediseasedtwinaccountedfor25．74％ ofallexpressedgenes．Itwasindicatingthatthe differencesingeneexpressionofonediseasedtwinweremoresignificantthanthatofthesamediseasedtwins．Comparedwith psoriasisgroupandcontrol