广西5个猪种mtDNA+D-loop序列遗传多样性及系统进化研究.pdfVIP

“疫百特”杯论文集 D—I 广西5个猪种mtDNAoop序列遗传多样性及系统进化研究 张冰，孙俊丽，潘天彪，蓝海恩，秦谦涛，黄敏瑞+ (广西畜牧研究所，广西南宁530001) 摘要：为了研究广西猪种遗传资源多样性及其亲缘关系，本实验测定了广西5个地方猪种(巴马香猪、 东山猪、桂中花猪、陆川猪、环江香猪)共85个样本的mtDNA D．100p区序列，结合已报道的国外猪种(杜 洛克、大约克和长白猪)的mtDNA D．100p序列进行分析，结果表明：广西各猪种之间遗传距离较小 化树将所分析样本分为2个独立的支系，一支包含了所有广西地方猪种和部分大约克的单倍型，另一支 则全部是三个国外猪种的单倍型。陆川猪在系统树上分布较为紧密，其它4个猪种都很分散，表明陆川猪 母源血统单一，其它4个猪种母源血统遗传背景比较复杂，彼此之间有基因交流。 关键词： 广西猪种；线粒体DNA控制区；遗传多样性；系统进化 高等动物线粒体DNA(mitochondrialDNA，mONA)存在于细胞质线粒体基质中，是独立于细胞核 染色体外的基因组，具有基因结构简单、稳定，碱基突变率高，遗传上具有自主性及遵循严格的母系遗 传等特点。mtDNA的非编码区(mtDNA D．100p)控制mtDNA的复制和转录，受进化的压力较小，进 化速率较快，遗传变异程度较高，广泛应用于哺乳动物群体遗传多样性、物种亲缘关系和分子系统发生 等方面的研究【嵋】。 广西拥有丰富的地方猪种资源，《广西畜禽品种志》记载的有巴马香猪、东山猪、桂中花猪、陆川猪、 环江香猪、隆林猪、德保猪等，其中香猪和陆川猪列入了国家级畜禽品种资源保护名录。广西地方猪种 具有繁殖力高、肉质好、抗逆性强、耐粗饲等诸多特点，因而广泛用作杂交改良母本。近年来，国外优 秀种猪被大量引入广西，这在促进广西地方猪种改良提高的同时，也造成了广西地方猪种纯度的陡然下 降和遗传资源的严重丢失，因而有必要对广西地方猪种的遗传多样性及其亲缘关系进行研究。本研究分 析广西5个地方猪种mtDNA D—loop序列，从分子水平 D．100p区序列，结合已报道的国外猪种的mtDNA 探讨广西地方猪种的遗传多样性及其亲缘关系，为广西猪种遗传资源的开发利用和保护提供科学依据。 1材料与方法 1．1试验材料 广西5个地方猪种(巴马香猪、东山猪、桂中花猪、陆川猪、环江香猪)的样品采集信息见表l。根 据系谱资料分别选取有代表性的猪取其耳组织，置于75％酒精中带回实验室。 作者简介：张冰(1979．)，男，河南鲁山人，硕士，主要从事动物分子遗传育种 第五次全国会员代表大会暨养猪业创新发展论坛 ◎ 表1样本信息 Tablel information Samples 1．2基因组DNA抽提 参考《分子克隆实验指南》的酚．氯仿抽提法提取基因组DNA[31。 1．3PCR扩增和序列测定 2．5p u u DNA L，引物(10 D．100p区序列。PCR反应体系：10XbufferL，dNTP(10mmol／L)2mol／L)luL，Taq 100 p 聚合酶1U，模板DNA L。PCR扩增反应条件为：95℃预变性5min，32个循环 ng，加双蒸水至25 S，54℃退火50S，72℃延伸1min)，72℃延伸10rain，4℃保存。PCR产物经回收纯 (95℃变性50 化后送北京诺赛基因组研究中心