谷子K3Y762基因结构的分析与功能挖掘.pdfVIP

谷子K3Y762基因结构分析与功能挖掘 任课教师：罗静初 教 授 小组成员：胡利芹 尹丽娟 李珊珊 杜丽媛 报告人： 胡利芹 报告时间：2013年1月20日 中国农业科学院2012级生物信息学硕士班 汇报内容 一、研究背景 二、NAC家族蛋白结构与功能简介 三、K3Y762序列、结构分析 四、核定位信号和亚细胞定位分析 五、 研究背景 转录因子(Transcription factor)是一类调节基因表达水平上的重要调控 基因, 通过与靶标基因启动子中特定的DNA序列结合, 激活或抑制靶标基因的 转录表达。NAC转录因子是植物特有的一类转录因子,最早在矮牵牛 (Pharbifis nil)NAM、拟南芥(Ara-bidopsis thaliana)ATAF1/2和CUC2基因 编码蛋白的N端中发现一段高度保守的氨基酸序列,由约150个氨基酸组成的 NAC结构域,并命名为NAC结构域,并将包含NAC结构域的蛋白称为NAC转录因子， 而C端为高度变异的转录调控区。NAC结构域一般由约150个氨基酸组成, 可分 为A、B、C、D、E等5个亚结构域, 而最初鉴定的NAM结构域则由A、B、C、D亚 结构域组成, 其中A、C、D 3个亚结构域在不同的物种中都是高度保守的, C、 D亚结构域中含有核定位信号, 而B、E亚结构域的保守性不强。 研究表明, NAC转录因子不仅参与植物生长发育的调控, 而且在植物抗逆反 应中具有重要的调控作用。 相关文献：Functions of NAC transcription factors in biotic and abiotic stress responses in plants SUN Li-Jun, LI Da-Yong, ZHANG Hui-Juan, SONG Feng-Ming State Key Laboratory for Rice Biology, Institute of Biotechnology, Zhejiang University, Hangzhou 310029, China NAM and NAC domains and TAR in a NAC family protein. Crystal structure of the NAC domain NAC转录因子在植物抗逆反应中的作用 1、NAC转录因子在植物抗非生物逆境胁迫中的作用 干旱、高盐是影响植物生长发育的主要逆境因子。当 植物处于干旱、高盐的胁迫下, 植物细胞会感知外界的胁 迫信号, 通过一系列复杂的信号传导途径如ABA信号途径, 把信号传递到胁迫应答的转录因子, 由各类转录因子启动 胁迫应答反应基因表达, 从而激活植物抗逆反应, 降低或消 除干旱、高盐逆境所造成的伤害。研究发现, NAC转录因子 直接参与或通过调控参与干旱、高盐应答基因的表达, 在 植物抗干旱、高盐等非生物逆境胁迫中起重要作用。 2、NAC转录因子在抗病反应中的作用 植物在其生长发育的环境中, 经常会受到细菌、真菌 和病毒等病原物的侵害, 促使植物形成了一系列复杂的抗 病机制。在受到病原菌的侵染时,植物通常通过水杨酸 (Salicylic acid, SA)、茉莉酸(Jasmonic acid, JA)、乙 烯(Ethylene, ET)等抗病信号传导途径来活化一大批防卫 反应基因的协同表达, 从而激活植物的抗病防卫反应。研 究显示, AP2/ERF、bZIP、WRKY等不同类型的转录因子参与 植物抗病反应中防卫基因的表达调控。近年来的研究表明, NAC转录因子家族基因在植物对不同类型病原菌的抗病反应 中起重要作用。 K3Y762序列 进化树分析 K3Y762结构预测分析 A B C D AA序列位点81 101 115 126 139 175 196 225 其中A结构域中最保守位点：G(83)、F(86)、P(88)、E(92) B结构域中最保守位点: L(126) C结构域中最保守位点: F(141)、G(152)、W(166) D结构域