乙肝相关性肝癌差异表达基因de获得及folr1分析研究.pdfVIP

第 10卷 第2期 生 物 信 息 学 V0l-l0No．2 2012年06月 ChineseJoumalofBioinformatics Jun．，2012 doi：10．3969／j．issn．1672—5565．2012．02．09 乙肝相关性肝癌差异表达基 因的获得及 FOLR1分析 姚 杨 ，苏 杰 ，刘凯歌，许刚柱，徐 锐 (西安医学院附属医院，西安 710077) 摘 要：运用基因芯片技术获取以稳定转染HBx基因的肝癌细胞 HepG (HepG2一X)及非转染的肝癌细胞HepG：中差异表达 的基因，并对其中一条基 因进行 的生物信息学分析。采用人肝癌 G2细胞 (HepG2)细胞 系为对照组，以稳定转染HBx的 HepG2细胞为实验组，抽取总RNA，经过反转录cDNA，对照组用Cy3实验组用Cy5荧光标记，获得 cDNA探针；经杂交、洗涤 后，通过ImaGene3．0软件进行分析统计。通过基因芯片筛选，获得643条与乙肝相关性肝细胞性癌相关的基 因，其中FOLR1 基因差异性表达最显著，HBx显著下调其表达，同源性比较分析结果表明，其碱基序列与已经报道的其他 12种哺乳动物的相 似率为67％一99％，且符合种属之间的进化关系。基因芯片筛选HBx诱导的HepG：差异表达基 因具有样 品用量少，高质量， 高速度，高敏感等特性。FOLR1可能为HBV相关肝癌的发生、转移的诊断、靶基因治疗和预后评估提供一定的依据。 关键词：乙肝相关性肝癌 ；乙肝病毒x蛋白；基因芯片；叶酸受体一1 中图分类号：Q518．2 文献标识码 ：A 文章编号：1672—5565(2012)一02—101—06 Isolation ofFOLR1generelatedtohepat0cellularcarcinoma YAOYang ，SU Jie，LIU Kai—ge，XU Gang-zhu，XU Rui (TheFirstAffiliatedHospitalofxiallmedicalUniversity，Xi’an，71oo77，China) Abstract：ToobtaindifferentiallyexpressedgenesrelatedtohumanHepG2usingcDNA microarrayandevaluatethe characterizationofFOLR1．TotalRNA wasextractedandmRNA wasusedtomakeprobes，Afterhybridizationand washingprocedure，theruseltsofhybriziationweresacnnedusingImaGene3．0software 643differentiallyexpressed genestoHepG2wereobtained ．FOLR1waslow —expressed inExperimentalgroup andoverexpressedin control group，TheanalysisofBLASTp showed thattheisolatedFOLR1shows67％ 一99％ identitywiththeothersspe— cies．cDNA microarraytechnologycanbesuccessfullyappliedtoidentifydifferentiallyexpressedgenes，theFOLR1 geneofhumanmaybecorrelatewithpathogenesisofhumanHCC．HBxmayplayanimportantroleinangiogenesis ofhepatocellularcarcinomabydownregulatingFOLR1expression． Keywords：HBV—relatedhepatocellularcarcinoma；hepatitisB virusX protein；cDNA microarrytechnology；fo— latereceptor1 目前，我 国每年约有 11～13万人死于原发