10 第十讲(1) 遗传标记.pptVIP

遗传标记 (Genetic markers) 1 遗传标记 概念： 指可以明确反映遗传多态性的生物特征，它可以帮助我们更好地研究生物的遗传与变异规律。 2 作为遗传标记应具备的条件： （1）多态性高； （2）最好表现为共显性； （3）对主要农艺性状影响小； （4）经济方便，容易观察记载。 3 遗传标记的类型 （1）形态标记 morphological markers （2）细胞学标记 cytological markers （3）生化标记 biochemical markers （4）分子标记 molecular markers 3.1 形态标记(morphological markers) 是指植物的外部形态特征，如矮秆、白化、黄化、变态叶、雄性不育等。 广义上还包括色素、生理特征、生殖特性、抗虫抗病性等。 形态标记的获得 一般通过自然突变或物化诱变来获得具有特定形态特征的遗传标记材料。 通过不同标记基因材料之间的相互杂交，可以选择出具有多个标记基因的材料。 3.2 细胞学标记(cytological markers)： 是指细胞内染色体的变化，包括染色体数目的变化(如单体、缺体、三体、四体 )或染色体结构的变异(如缺失、易位、倒位、重复等 )。 可通过染色体核型（染色体数目、大小、随体有无、着丝粒位置等）和带型（C、N、G带等）分析来测定基因所在的染色体及相对位置，或通过染色体置换等进行基因的定位。 3.3 生化标记(biochemical markers) 主要包括贮藏蛋白、同工酶和等位酶等。种子中的贮藏蛋白主要包括白蛋白、球蛋白、醇溶蛋白和谷蛋白四种。不同植物种子中的贮藏蛋白含量不同。 生化标记的使用首次突破了把整株样品作为研究材料进行分析的方式，并可以直接反映基因产物的差异，受环境的影响较小。但标记数量远远不能满足实际的需要。 3.4 分子标记 (molecular markers) 是指基因组DNA分子水平之间的差异。 优越性： （1）直接以DNA的形式表现； （2）数量多，遍及整个基因组，检测位点近乎无限； （3）多态性高，不需要专门创造特殊的遗传材料； （4）不影响目标性状的表达，与不良性状无必然的连锁； （5）有许多分子标记表现为共显性。 分子标记的主要类型 ⑴ 以分子杂交为基础的DNA标记技术 限制性片段长度多态性（Restriction fragment length polymorphisms，RFLP） 可变数目串联重复序序列（Variable number of tandem repeats，VNTR） 染色体原位杂交（In Situ Hybridization） ⑵ 以PCR为基础的DNA标记技术 随机扩增多态性DNA（Random amplification polymorphism DNA，RAPD） 简单重复序列间区DNA（Inter-simple sequence repeats polymorphisms，ISSR） 简单序列重复(微卫星) DNA（Simple sequence repeats，SSR） 扩增片段长度多态性（Amplified fragment length polymorphisms，AFLP） 相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism，SRAP) ⑶ 其它类型的分子标记 单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism，SNP） 表达序列标签（Expressed sequences tags，EST） 反转录转座子（Retro-transposon） * * 鸡脚叶 L20 棕色纤维 Lc1 光籽 N1 无腺体 gl1 黄花粉 P1 窄卷苞叶 fg 密生茸毛 T1 杯状叶 cu 黄花瓣 Y1 芽黄 v1 花瓣斑点 R2 丛生铃 cl1 T582 红株 R1 T586 标记性状 基因符号 品系 标记性状 基因符号 品系 棉花多标记基因材料