小麦PM H＋-ATPase基因克隆及其推定的蛋白结构分析.pdfVIP

麦类作物学报 2009，29(6)：947953 Journa1ofTriticeaeCrops 小麦PM H+-ATPase基因克隆及其推定的蛋白结构分析 陈军营，崔 琰，舒文涛，赵一丹 ，陈新建 (河南农业大学农学院，河南郑州 450002) 摘 要 ：为 了解小麦 PM H+_ATPase的基 因全序列及其相关生物信 息学特征 ，以豫麦 18的基 因组 DNA 为 材料 ，用 Full—Tail—PCR方法首 次克隆到 了小麦 PM H—ATPase基 因的启动子 ，并用分段 克隆方 法克隆 了其 全长 序列(登录号：AY829002)。DNA序列分析结果表 明，该基 因全长 577Obp，含有 15个外显子和 14个 内舍子 ．其 中 第一个 内含子片段较大 ，长达 1432bp。碱基组分分析结果表 明，该基 因的启动子及 5UTR全长分别为 161和 201bp，G+C含量分别高达 72．1 和 72．6 。对其生物信 息学特征分析结果表 明，该蛋 白由951个氨基酸组成 ， 分子量为104．6kD，有44个功能位点，1O个跨膜区，1个CationATPase结构域 ，1个E1E2ATPase结构域和 1个 水解酶结构域。与其他植物序列比对分析结果表 明，不 同植物来源 PM H一一ATPase具有较高的保守性。该基 因 结构及其推定产物结构的复杂性说 明该基 因在生命活动调节 中的精确性 。 关键词 ：小麦 ；PM H 一ATPase；基 因克隆 ；蛋 白结构 中图分类号 ：S512．1；$330 文献标识码 ：A 文章编号 ：1009—1O41(2009)06—0947-07 CloningofW heatPM H+-ATPaseGeneand AnalysisofPutativeProteinStructure CHEN Jun—ying，CUIYan，SHUWen—tao，ZHAoYi—dan，CHENXin-jian (CollegeofAgronomy，HenanAgriculturalUniversity，Zhengzhou ，Henan450002，China) Abstract：PM H 一ATPaseplaysanimportantroleinwheatdevelopment，butcloningofitsfulllengthse— quenceandanalysisofitsputativeproteinstructurewererarelyreported．UsingthegenomicDW A ofYu— mai18astemplate，thepromoterand full—length sequenceofPM H ATPasegenewereclonedby the methodofFull—Tail—PCR inwheat(Genbankaccession：AY829002)．DNA sequenceanalysisshowedthat thetotallengthofthisgenewas5770bp，whichwith15exonsand14intronsandthefirstintronwasthe longest，upto 1432 bp．Basecomponentanalysisshowed theG+ C contentin itspromoterand5UTR reached72．1 and72．6％．BioinformaticsanalysisofputativePM H 一ATPaseshowedthatthisprotein contained951aminoacidswithmolecularweightof104，6kD，44functionalsites，10transmembranere— gions，oneCation—ATPasedomain，oneE1—2一ATPasedomain，andonehydrolasedomain．Sequencesalign mentanalysisshowedthatthePM H。‘一ATPasefrom different