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- 2017-08-29 发布于重庆
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CPMD方法对醋酸-水物理化学 李丽 MG0824089
南京大学化学化工学院 南京210093
CPMD执行乙酸-水体系的分子动力学模拟,表现了从头算分子动力学模拟的基本流程,即
1. 建立模型,确立边界条件和相互作用的算法;
2. 针对初始化构型,优化体系波函数;
3. 进行分子动力学迭代,使体系能量收敛,获取轨迹数据;
4. 利用输出数据以及终态构型进一步开展有关体系其他方面性质的计算,包括能级排布、电荷密度分布、键级、与化学环境有关的IR和NMR谱图的计算等。
通过关于乙酸-水这一具体溶液体系的分子动力学,获得了丰富的计算机模拟数据并进一步采用二次计算和图像生成的手段加以处理,转换为有关体系各方面性质的有用信息,其正确性与精确程度有待与实验数据做进一步的比较,然而对各方面信息加以分析和总结的过程确实深化了对量子化学以及分子力学和分子动力学方面知识的理解和运用。
实验步骤
1. 用HyperChem软件建模,构造立方格子。
2. 首先选择关键词OPTIMIZE WAVEFUNCTION进行波函数的优化。用HyperChem软件建模得到的分子坐标经过整理作为CPMD计算的输入文件。取ENERGIES文件中的数据作图。
通过构建的电荷密度图形,可以清楚的看到在C-C 和C-O 间电荷密度明显增大,形成的是C-Cσ键和C-Oσ键。
4. 本次作业计算中,运用CPMD
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