香菇基因组De novo测序与分析揭示了其独特的降解木质纤维素的能力.pdfVIP

香菇基因组Derlovo测序与分析揭示了其独特的降解木质纤 维素的能力 陈连福边银丙+龚钰华 肖扬周雁 ，华中农业大学应用真菌研究所湖北武汉430070 摘要：对香菇单核体菌株W1．26进行了基因组测序和DeHOVO组装，获得了大小为39．Mb的基因组序列。香菇基因组中的 物种中存在orthologs。根据524个单拷贝同源基因所得的系统发育树准确的验证了多个真菌物种之间的亲缘关系以及香菇 的分类地位。此外，通过比较这14种真菌的碳水化合物活性酶家族，表明了香菇中具有降解多糖功能的基因数目高于其它 大型真菌，分解木质素的AAl和AA2家族的基因总数高于其它真菌，揭示了香菇作为一种白腐真菌，具有着极强的降解 木质纤维素的潜在能力。 关键词：基因组测序，香菇，基因预测，功能注释，直系同源，碳水化合物活性酶 novo edodes De and ofLentinula sequencinganalysis genome revealsits ofwood uniquecapacity degradation CHEN Yan Lian—Fu，BIAN Yu—Hua，XIA0 Yin—bin94，GONG Yang，ZHOU 1Institute 430070,China ofAppliedMycologyofHuaZhongAgriculturalUniversity,Wuhan,Hubei W1—26 Abstract：．Theofthe strain ofLentinulaedodeswas was genomehaploid sequenced．39Mbgenome assembliedDeHOVOThis contains ofthe by genome approximately9．88％repetitivesequences．Themajority are of LTRs．In modelswere an total，12，936 2，069 repeats gene predicted，withaveragesequencelength bp．On contain6．72 94．6％ofthe average，eachpredictedgene CDSs，with genescontaining the were searchesNrdatabase and49．88％ofthe 83．5％of annotated byBLASTR genes bysimilarity against wereannotatedwith ofthe ofL．edodeswiththoseofother genes geneontology(GO)term．Clusteringproteins 13 identifies atleastoneL．edodes oftheseclusters sequencedfungi 7,212 containing